Protein–RNA interactions for Protein: P28288

ABCD3, ATP-binding cassette sub-family D member 3, humanhuman

Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCD3P28288 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ABCD3P28288 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ABCD3P28288 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ABCD3P28288 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ABCD3P28288 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ABCD3P28288 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ABCD3P28288 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ABCD3P28288 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ABCD3P28288 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ABCD3P28288 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ABCD3P28288 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ABCD3P28288 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ABCD3P28288 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ABCD3P28288 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ABCD3P28288 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ABCD3P28288 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ABCD3P28288 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ABCD3P28288 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ABCD3P28288 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ABCD3P28288 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ABCD3P28288 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ABCD3P28288 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ABCD3P28288 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ABCD3P28288 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ABCD3P28288 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ABCD3P28288 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ABCD3P28288 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ABCD3P28288 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ABCD3P28288 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ABCD3P28288 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ABCD3P28288 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ABCD3P28288 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ABCD3P28288 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ABCD3P28288 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ABCD3P28288 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ABCD3P28288 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ABCD3P28288 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ABCD3P28288 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ABCD3P28288 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ABCD3P28288 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ABCD3P28288 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ABCD3P28288 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ABCD3P28288 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ABCD3P28288 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ABCD3P28288 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ABCD3P28288 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ABCD3P28288 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ABCD3P28288 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ABCD3P28288 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ABCD3P28288 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ABCD3P28288 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ABCD3P28288 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ABCD3P28288 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
ABCD3P28288 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ABCD3P28288 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ABCD3P28288 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ABCD3P28288 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ABCD3P28288 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ABCD3P28288 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ABCD3P28288 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ABCD3P28288 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ABCD3P28288 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ABCD3P28288 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ABCD3P28288 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ABCD3P28288 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ABCD3P28288 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ABCD3P28288 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
ABCD3P28288 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
ABCD3P28288 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ABCD3P28288 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
ABCD3P28288 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ABCD3P28288 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ABCD3P28288 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ABCD3P28288 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ABCD3P28288 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ABCD3P28288 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ABCD3P28288 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ABCD3P28288 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ABCD3P28288 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ABCD3P28288 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ABCD3P28288 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ABCD3P28288 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ABCD3P28288 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ABCD3P28288 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ABCD3P28288 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ABCD3P28288 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ABCD3P28288 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ABCD3P28288 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ABCD3P28288 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ABCD3P28288 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ABCD3P28288 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ABCD3P28288 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ABCD3P28288 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ABCD3P28288 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ABCD3P28288 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ABCD3P28288 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ABCD3P28288 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ABCD3P28288 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ABCD3P28288 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ABCD3P28288 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms