Protein–RNA interactions for Protein: P26358

DNMT1, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNMT1P26358 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC30.65■■■□□ 2.5
DNMT1P26358 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC30.65■■■□□ 2.5
DNMT1P26358 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
DNMT1P26358 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC30.65■■■□□ 2.5
DNMT1P26358 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC30.65■■■□□ 2.5
DNMT1P26358 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
DNMT1P26358 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
DNMT1P26358 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC30.64■■■□□ 2.5
DNMT1P26358 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.64■■■□□ 2.5
DNMT1P26358 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
DNMT1P26358 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC30.64■■■□□ 2.5
DNMT1P26358 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
DNMT1P26358 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.49
DNMT1P26358 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.49
DNMT1P26358 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.49
DNMT1P26358 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.63■■■□□ 2.49
DNMT1P26358 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.63■■■□□ 2.49
DNMT1P26358 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
DNMT1P26358 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
DNMT1P26358 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.63■■■□□ 2.49
DNMT1P26358 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
DNMT1P26358 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC30.63■■■□□ 2.49
DNMT1P26358 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC30.63■■■□□ 2.49
DNMT1P26358 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.63■■■□□ 2.49
DNMT1P26358 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC30.63■■■□□ 2.49
DNMT1P26358 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.63■■■□□ 2.49
DNMT1P26358 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.63■■■□□ 2.49
DNMT1P26358 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
DNMT1P26358 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.63■■■□□ 2.49
DNMT1P26358 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
DNMT1P26358 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
DNMT1P26358 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC30.63■■■□□ 2.49
DNMT1P26358 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
DNMT1P26358 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
DNMT1P26358 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
DNMT1P26358 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.62■■■□□ 2.49
DNMT1P26358 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC30.62■■■□□ 2.49
DNMT1P26358 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
DNMT1P26358 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC30.62■■■□□ 2.49
DNMT1P26358 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC30.62■■■□□ 2.49
DNMT1P26358 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
DNMT1P26358 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
DNMT1P26358 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
DNMT1P26358 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
DNMT1P26358 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
DNMT1P26358 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
DNMT1P26358 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC30.62■■■□□ 2.49
DNMT1P26358 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
DNMT1P26358 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.62■■■□□ 2.49
DNMT1P26358 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.62■■■□□ 2.49
DNMT1P26358 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
DNMT1P26358 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
DNMT1P26358 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
DNMT1P26358 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
DNMT1P26358 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.61■■■□□ 2.49
DNMT1P26358 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
DNMT1P26358 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
DNMT1P26358 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
DNMT1P26358 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC30.61■■■□□ 2.49
DNMT1P26358 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC30.61■■■□□ 2.49
DNMT1P26358 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
DNMT1P26358 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
DNMT1P26358 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
DNMT1P26358 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
DNMT1P26358 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
DNMT1P26358 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
DNMT1P26358 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
DNMT1P26358 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
DNMT1P26358 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
DNMT1P26358 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
DNMT1P26358 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC30.6■■■□□ 2.49
DNMT1P26358 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC30.6■■■□□ 2.49
DNMT1P26358 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
DNMT1P26358 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC30.6■■■□□ 2.49
DNMT1P26358 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.6■■■□□ 2.49
DNMT1P26358 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC30.6■■■□□ 2.49
DNMT1P26358 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
DNMT1P26358 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
DNMT1P26358 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.6■■■□□ 2.49
DNMT1P26358 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
DNMT1P26358 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
DNMT1P26358 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
DNMT1P26358 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
DNMT1P26358 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
DNMT1P26358 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
DNMT1P26358 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
DNMT1P26358 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
DNMT1P26358 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
DNMT1P26358 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
DNMT1P26358 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
DNMT1P26358 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
DNMT1P26358 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
DNMT1P26358 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
DNMT1P26358 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
DNMT1P26358 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
DNMT1P26358 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
DNMT1P26358 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
DNMT1P26358 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
DNMT1P26358 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC30.58■■■□□ 2.49
DNMT1P26358 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms