Protein–RNA interactions for Protein: P23443

RPS6KB1, Ribosomal protein S6 kinase beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 525 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KB1P23443 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RPS6KB1P23443 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RPS6KB1P23443 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RPS6KB1P23443 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RPS6KB1P23443 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RPS6KB1P23443 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RPS6KB1P23443 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RPS6KB1P23443 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RPS6KB1P23443 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RPS6KB1P23443 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
RPS6KB1P23443 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RPS6KB1P23443 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RPS6KB1P23443 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RPS6KB1P23443 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RPS6KB1P23443 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RPS6KB1P23443 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RPS6KB1P23443 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RPS6KB1P23443 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RPS6KB1P23443 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RPS6KB1P23443 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RPS6KB1P23443 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RPS6KB1P23443 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RPS6KB1P23443 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RPS6KB1P23443 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RPS6KB1P23443 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RPS6KB1P23443 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RPS6KB1P23443 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RPS6KB1P23443 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
RPS6KB1P23443 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RPS6KB1P23443 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
RPS6KB1P23443 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
RPS6KB1P23443 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RPS6KB1P23443 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RPS6KB1P23443 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RPS6KB1P23443 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RPS6KB1P23443 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RPS6KB1P23443 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RPS6KB1P23443 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RPS6KB1P23443 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
RPS6KB1P23443 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RPS6KB1P23443 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RPS6KB1P23443 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RPS6KB1P23443 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RPS6KB1P23443 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RPS6KB1P23443 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RPS6KB1P23443 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RPS6KB1P23443 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RPS6KB1P23443 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RPS6KB1P23443 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RPS6KB1P23443 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RPS6KB1P23443 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RPS6KB1P23443 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RPS6KB1P23443 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RPS6KB1P23443 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RPS6KB1P23443 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RPS6KB1P23443 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RPS6KB1P23443 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RPS6KB1P23443 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RPS6KB1P23443 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RPS6KB1P23443 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RPS6KB1P23443 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
RPS6KB1P23443 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RPS6KB1P23443 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RPS6KB1P23443 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RPS6KB1P23443 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RPS6KB1P23443 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RPS6KB1P23443 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RPS6KB1P23443 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RPS6KB1P23443 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RPS6KB1P23443 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RPS6KB1P23443 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RPS6KB1P23443 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RPS6KB1P23443 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RPS6KB1P23443 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RPS6KB1P23443 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
RPS6KB1P23443 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
RPS6KB1P23443 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RPS6KB1P23443 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RPS6KB1P23443 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RPS6KB1P23443 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RPS6KB1P23443 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RPS6KB1P23443 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RPS6KB1P23443 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
RPS6KB1P23443 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RPS6KB1P23443 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RPS6KB1P23443 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RPS6KB1P23443 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RPS6KB1P23443 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RPS6KB1P23443 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RPS6KB1P23443 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RPS6KB1P23443 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RPS6KB1P23443 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RPS6KB1P23443 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RPS6KB1P23443 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RPS6KB1P23443 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RPS6KB1P23443 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RPS6KB1P23443 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RPS6KB1P23443 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RPS6KB1P23443 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RPS6KB1P23443 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms