Protein–RNA interactions for Protein: P22888

LHCGR, Lutropin-choriogonadotropic hormone receptor, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHCGRP22888 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
LHCGRP22888 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
LHCGRP22888 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
LHCGRP22888 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
LHCGRP22888 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
LHCGRP22888 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
LHCGRP22888 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
LHCGRP22888 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
LHCGRP22888 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
LHCGRP22888 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
LHCGRP22888 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
LHCGRP22888 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
LHCGRP22888 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
LHCGRP22888 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
LHCGRP22888 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
LHCGRP22888 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
LHCGRP22888 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
LHCGRP22888 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
LHCGRP22888 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
LHCGRP22888 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
LHCGRP22888 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
LHCGRP22888 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
LHCGRP22888 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
LHCGRP22888 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
LHCGRP22888 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
LHCGRP22888 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
LHCGRP22888 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
LHCGRP22888 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
LHCGRP22888 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
LHCGRP22888 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
LHCGRP22888 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
LHCGRP22888 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
LHCGRP22888 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
LHCGRP22888 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
LHCGRP22888 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
LHCGRP22888 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
LHCGRP22888 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
LHCGRP22888 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
LHCGRP22888 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
LHCGRP22888 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
LHCGRP22888 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
LHCGRP22888 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
LHCGRP22888 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
LHCGRP22888 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
LHCGRP22888 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
LHCGRP22888 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
LHCGRP22888 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
LHCGRP22888 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
LHCGRP22888 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
LHCGRP22888 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
LHCGRP22888 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
LHCGRP22888 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
LHCGRP22888 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
LHCGRP22888 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LHCGRP22888 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LHCGRP22888 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LHCGRP22888 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LHCGRP22888 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LHCGRP22888 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LHCGRP22888 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
LHCGRP22888 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
LHCGRP22888 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
LHCGRP22888 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
LHCGRP22888 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
LHCGRP22888 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LHCGRP22888 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
LHCGRP22888 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LHCGRP22888 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LHCGRP22888 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LHCGRP22888 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
LHCGRP22888 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
LHCGRP22888 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
LHCGRP22888 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
LHCGRP22888 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
LHCGRP22888 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LHCGRP22888 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LHCGRP22888 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LHCGRP22888 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
LHCGRP22888 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
LHCGRP22888 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.25■□□□□ 0.83
LHCGRP22888 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LHCGRP22888 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LHCGRP22888 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LHCGRP22888 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LHCGRP22888 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LHCGRP22888 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LHCGRP22888 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LHCGRP22888 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LHCGRP22888 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LHCGRP22888 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LHCGRP22888 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LHCGRP22888 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LHCGRP22888 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
LHCGRP22888 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LHCGRP22888 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LHCGRP22888 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LHCGRP22888 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LHCGRP22888 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LHCGRP22888 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LHCGRP22888 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms