Protein–RNA interactions for Protein: P22670

RFX1, MHC class II regulatory factor RFX1, humanhuman

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFX1P22670 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RFX1P22670 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RFX1P22670 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RFX1P22670 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RFX1P22670 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RFX1P22670 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RFX1P22670 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RFX1P22670 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RFX1P22670 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RFX1P22670 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RFX1P22670 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RFX1P22670 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RFX1P22670 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RFX1P22670 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
RFX1P22670 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RFX1P22670 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
RFX1P22670 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RFX1P22670 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RFX1P22670 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RFX1P22670 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RFX1P22670 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RFX1P22670 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RFX1P22670 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RFX1P22670 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RFX1P22670 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RFX1P22670 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RFX1P22670 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RFX1P22670 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RFX1P22670 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
RFX1P22670 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RFX1P22670 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RFX1P22670 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RFX1P22670 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RFX1P22670 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RFX1P22670 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RFX1P22670 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RFX1P22670 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RFX1P22670 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
RFX1P22670 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
RFX1P22670 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RFX1P22670 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RFX1P22670 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RFX1P22670 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RFX1P22670 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RFX1P22670 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RFX1P22670 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
RFX1P22670 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RFX1P22670 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
RFX1P22670 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RFX1P22670 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RFX1P22670 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
RFX1P22670 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
RFX1P22670 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RFX1P22670 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
RFX1P22670 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
RFX1P22670 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RFX1P22670 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RFX1P22670 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RFX1P22670 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RFX1P22670 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RFX1P22670 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RFX1P22670 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RFX1P22670 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RFX1P22670 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RFX1P22670 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RFX1P22670 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RFX1P22670 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RFX1P22670 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RFX1P22670 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RFX1P22670 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RFX1P22670 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RFX1P22670 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RFX1P22670 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RFX1P22670 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RFX1P22670 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RFX1P22670 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RFX1P22670 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RFX1P22670 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RFX1P22670 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RFX1P22670 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RFX1P22670 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RFX1P22670 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RFX1P22670 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RFX1P22670 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RFX1P22670 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RFX1P22670 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RFX1P22670 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RFX1P22670 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RFX1P22670 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RFX1P22670 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RFX1P22670 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RFX1P22670 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RFX1P22670 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RFX1P22670 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RFX1P22670 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RFX1P22670 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RFX1P22670 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RFX1P22670 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RFX1P22670 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RFX1P22670 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms