Protein–RNA interactions for Protein: P20963

CD247, T-cell surface glycoprotein CD3 zeta chain, humanhuman

Predictions only

Length 164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD247P20963 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CD247P20963 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CD247P20963 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
CD247P20963 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CD247P20963 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CD247P20963 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CD247P20963 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CD247P20963 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
CD247P20963 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
CD247P20963 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CD247P20963 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CD247P20963 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CD247P20963 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CD247P20963 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CD247P20963 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CD247P20963 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CD247P20963 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CD247P20963 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CD247P20963 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CD247P20963 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CD247P20963 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CD247P20963 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CD247P20963 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CD247P20963 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
CD247P20963 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CD247P20963 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CD247P20963 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CD247P20963 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CD247P20963 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CD247P20963 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
CD247P20963 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
CD247P20963 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CD247P20963 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CD247P20963 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CD247P20963 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CD247P20963 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
CD247P20963 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CD247P20963 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CD247P20963 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CD247P20963 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CD247P20963 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CD247P20963 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CD247P20963 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CD247P20963 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CD247P20963 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CD247P20963 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CD247P20963 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CD247P20963 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CD247P20963 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CD247P20963 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CD247P20963 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CD247P20963 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CD247P20963 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CD247P20963 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CD247P20963 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CD247P20963 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CD247P20963 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CD247P20963 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CD247P20963 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CD247P20963 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CD247P20963 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CD247P20963 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CD247P20963 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CD247P20963 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CD247P20963 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CD247P20963 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CD247P20963 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CD247P20963 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CD247P20963 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CD247P20963 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CD247P20963 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CD247P20963 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CD247P20963 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CD247P20963 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CD247P20963 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CD247P20963 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CD247P20963 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CD247P20963 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CD247P20963 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CD247P20963 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CD247P20963 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CD247P20963 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CD247P20963 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CD247P20963 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CD247P20963 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CD247P20963 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CD247P20963 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CD247P20963 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CD247P20963 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CD247P20963 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CD247P20963 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CD247P20963 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CD247P20963 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CD247P20963 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CD247P20963 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CD247P20963 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CD247P20963 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CD247P20963 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CD247P20963 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
CD247P20963 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms