Protein–RNA interactions for Protein: P20783

NTF3, Neurotrophin-3, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTF3P20783 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NTF3P20783 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NTF3P20783 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NTF3P20783 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NTF3P20783 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NTF3P20783 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NTF3P20783 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NTF3P20783 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NTF3P20783 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NTF3P20783 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NTF3P20783 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NTF3P20783 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NTF3P20783 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NTF3P20783 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
NTF3P20783 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NTF3P20783 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NTF3P20783 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NTF3P20783 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NTF3P20783 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
NTF3P20783 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NTF3P20783 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NTF3P20783 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NTF3P20783 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NTF3P20783 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NTF3P20783 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NTF3P20783 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NTF3P20783 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NTF3P20783 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NTF3P20783 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NTF3P20783 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NTF3P20783 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NTF3P20783 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NTF3P20783 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NTF3P20783 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NTF3P20783 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NTF3P20783 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NTF3P20783 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
NTF3P20783 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
NTF3P20783 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NTF3P20783 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NTF3P20783 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NTF3P20783 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NTF3P20783 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NTF3P20783 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NTF3P20783 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NTF3P20783 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NTF3P20783 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NTF3P20783 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NTF3P20783 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NTF3P20783 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NTF3P20783 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NTF3P20783 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NTF3P20783 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NTF3P20783 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NTF3P20783 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NTF3P20783 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NTF3P20783 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NTF3P20783 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NTF3P20783 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NTF3P20783 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NTF3P20783 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NTF3P20783 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NTF3P20783 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NTF3P20783 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NTF3P20783 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NTF3P20783 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NTF3P20783 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NTF3P20783 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NTF3P20783 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NTF3P20783 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NTF3P20783 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NTF3P20783 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NTF3P20783 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NTF3P20783 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
NTF3P20783 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
NTF3P20783 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
NTF3P20783 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NTF3P20783 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NTF3P20783 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NTF3P20783 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NTF3P20783 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NTF3P20783 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NTF3P20783 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NTF3P20783 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NTF3P20783 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NTF3P20783 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NTF3P20783 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NTF3P20783 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NTF3P20783 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NTF3P20783 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NTF3P20783 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NTF3P20783 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NTF3P20783 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NTF3P20783 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NTF3P20783 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NTF3P20783 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NTF3P20783 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NTF3P20783 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NTF3P20783 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NTF3P20783 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms