Protein–RNA interactions for Protein: P19876

CXCL3, C-X-C motif chemokine 3, humanhuman

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL3P19876 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CXCL3P19876 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CXCL3P19876 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CXCL3P19876 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
CXCL3P19876 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CXCL3P19876 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CXCL3P19876 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CXCL3P19876 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CXCL3P19876 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CXCL3P19876 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CXCL3P19876 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CXCL3P19876 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CXCL3P19876 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CXCL3P19876 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CXCL3P19876 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CXCL3P19876 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CXCL3P19876 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CXCL3P19876 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CXCL3P19876 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CXCL3P19876 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CXCL3P19876 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CXCL3P19876 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CXCL3P19876 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CXCL3P19876 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CXCL3P19876 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CXCL3P19876 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CXCL3P19876 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
CXCL3P19876 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CXCL3P19876 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CXCL3P19876 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CXCL3P19876 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CXCL3P19876 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CXCL3P19876 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CXCL3P19876 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CXCL3P19876 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CXCL3P19876 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CXCL3P19876 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CXCL3P19876 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CXCL3P19876 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CXCL3P19876 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CXCL3P19876 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CXCL3P19876 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CXCL3P19876 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CXCL3P19876 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CXCL3P19876 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CXCL3P19876 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CXCL3P19876 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CXCL3P19876 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CXCL3P19876 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CXCL3P19876 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CXCL3P19876 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CXCL3P19876 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CXCL3P19876 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CXCL3P19876 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CXCL3P19876 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CXCL3P19876 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CXCL3P19876 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CXCL3P19876 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CXCL3P19876 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CXCL3P19876 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CXCL3P19876 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
CXCL3P19876 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CXCL3P19876 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CXCL3P19876 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CXCL3P19876 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CXCL3P19876 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CXCL3P19876 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CXCL3P19876 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CXCL3P19876 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CXCL3P19876 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CXCL3P19876 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CXCL3P19876 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CXCL3P19876 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CXCL3P19876 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CXCL3P19876 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CXCL3P19876 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CXCL3P19876 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CXCL3P19876 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CXCL3P19876 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CXCL3P19876 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CXCL3P19876 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CXCL3P19876 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
CXCL3P19876 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CXCL3P19876 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CXCL3P19876 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
CXCL3P19876 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CXCL3P19876 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CXCL3P19876 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CXCL3P19876 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CXCL3P19876 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CXCL3P19876 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CXCL3P19876 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CXCL3P19876 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CXCL3P19876 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CXCL3P19876 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CXCL3P19876 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CXCL3P19876 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CXCL3P19876 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CXCL3P19876 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CXCL3P19876 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms