Protein–RNA interactions for Protein: P13569

CFTR, Cystic fibrosis transmembrane conductance regulator, humanhuman

Predictions only

Length 1,480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFTRP13569 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC35.22■■■■□ 3.23
CFTRP13569 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC35.22■■■■□ 3.23
CFTRP13569 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
CFTRP13569 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC35.21■■■■□ 3.23
CFTRP13569 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
CFTRP13569 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
CFTRP13569 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
CFTRP13569 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
CFTRP13569 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
CFTRP13569 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
CFTRP13569 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
CFTRP13569 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
CFTRP13569 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
CFTRP13569 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC35.2■■■■□ 3.23
CFTRP13569 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC35.2■■■■□ 3.23
CFTRP13569 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC35.2■■■■□ 3.23
CFTRP13569 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC35.2■■■■□ 3.23
CFTRP13569 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC35.2■■■■□ 3.23
CFTRP13569 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.22
CFTRP13569 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.22
CFTRP13569 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC35.2■■■■□ 3.22
CFTRP13569 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC35.19■■■■□ 3.22
CFTRP13569 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
CFTRP13569 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC35.19■■■■□ 3.22
CFTRP13569 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC35.19■■■■□ 3.22
CFTRP13569 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC35.19■■■■□ 3.22
CFTRP13569 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC35.19■■■■□ 3.22
CFTRP13569 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
CFTRP13569 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
CFTRP13569 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC35.18■■■■□ 3.22
CFTRP13569 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC35.18■■■■□ 3.22
CFTRP13569 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC35.18■■■■□ 3.22
CFTRP13569 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
CFTRP13569 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC35.18■■■■□ 3.22
CFTRP13569 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.18■■■■□ 3.22
CFTRP13569 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
CFTRP13569 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC35.18■■■■□ 3.22
CFTRP13569 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
CFTRP13569 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.17■■■■□ 3.22
CFTRP13569 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC35.17■■■■□ 3.22
CFTRP13569 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
CFTRP13569 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
CFTRP13569 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
CFTRP13569 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
CFTRP13569 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
CFTRP13569 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.16■■■■□ 3.22
CFTRP13569 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC35.16■■■■□ 3.22
CFTRP13569 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
CFTRP13569 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC35.16■■■■□ 3.22
CFTRP13569 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC35.16■■■■□ 3.22
CFTRP13569 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
CFTRP13569 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC35.16■■■■□ 3.22
CFTRP13569 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
CFTRP13569 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.16■■■■□ 3.22
CFTRP13569 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC35.15■■■■□ 3.22
CFTRP13569 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.15■■■■□ 3.22
CFTRP13569 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
CFTRP13569 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.15■■■■□ 3.22
CFTRP13569 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC35.15■■■■□ 3.22
CFTRP13569 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC35.15■■■■□ 3.22
CFTRP13569 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC35.15■■■■□ 3.22
CFTRP13569 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC35.15■■■■□ 3.22
CFTRP13569 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
CFTRP13569 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
CFTRP13569 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC35.14■■■■□ 3.22
CFTRP13569 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC35.14■■■■□ 3.22
CFTRP13569 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
CFTRP13569 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
CFTRP13569 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
CFTRP13569 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC35.14■■■■□ 3.22
CFTRP13569 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.14■■■■□ 3.22
CFTRP13569 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC35.14■■■■□ 3.22
CFTRP13569 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC35.14■■■■□ 3.22
CFTRP13569 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC35.14■■■■□ 3.22
CFTRP13569 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
CFTRP13569 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
CFTRP13569 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.13■■■■□ 3.22
CFTRP13569 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC35.13■■■■□ 3.21
CFTRP13569 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
CFTRP13569 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
CFTRP13569 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
CFTRP13569 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
CFTRP13569 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC35.13■■■■□ 3.21
CFTRP13569 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC35.13■■■■□ 3.21
CFTRP13569 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC35.13■■■■□ 3.21
CFTRP13569 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
CFTRP13569 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
CFTRP13569 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.12■■■■□ 3.21
CFTRP13569 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
CFTRP13569 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
CFTRP13569 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
CFTRP13569 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.12■■■■□ 3.21
CFTRP13569 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
CFTRP13569 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC35.12■■■■□ 3.21
CFTRP13569 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC35.12■■■■□ 3.21
CFTRP13569 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.11■■■■□ 3.21
CFTRP13569 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC35.11■■■■□ 3.21
CFTRP13569 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
CFTRP13569 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
CFTRP13569 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms