Protein–RNA interactions for Protein: P12980

LYL1, Protein lyl-1, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYL1P12980 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LYL1P12980 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LYL1P12980 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LYL1P12980 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LYL1P12980 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LYL1P12980 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LYL1P12980 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LYL1P12980 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LYL1P12980 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LYL1P12980 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LYL1P12980 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LYL1P12980 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LYL1P12980 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LYL1P12980 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LYL1P12980 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LYL1P12980 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LYL1P12980 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LYL1P12980 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LYL1P12980 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LYL1P12980 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LYL1P12980 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LYL1P12980 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LYL1P12980 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LYL1P12980 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LYL1P12980 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LYL1P12980 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LYL1P12980 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LYL1P12980 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LYL1P12980 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LYL1P12980 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LYL1P12980 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
LYL1P12980 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LYL1P12980 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LYL1P12980 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LYL1P12980 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LYL1P12980 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LYL1P12980 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LYL1P12980 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LYL1P12980 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LYL1P12980 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LYL1P12980 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
LYL1P12980 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LYL1P12980 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LYL1P12980 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LYL1P12980 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LYL1P12980 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LYL1P12980 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LYL1P12980 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LYL1P12980 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LYL1P12980 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LYL1P12980 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LYL1P12980 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LYL1P12980 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LYL1P12980 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LYL1P12980 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LYL1P12980 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LYL1P12980 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LYL1P12980 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
LYL1P12980 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LYL1P12980 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LYL1P12980 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LYL1P12980 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LYL1P12980 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LYL1P12980 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LYL1P12980 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LYL1P12980 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LYL1P12980 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LYL1P12980 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LYL1P12980 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LYL1P12980 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LYL1P12980 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LYL1P12980 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LYL1P12980 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LYL1P12980 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LYL1P12980 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
LYL1P12980 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LYL1P12980 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LYL1P12980 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LYL1P12980 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LYL1P12980 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LYL1P12980 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LYL1P12980 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LYL1P12980 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LYL1P12980 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LYL1P12980 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LYL1P12980 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LYL1P12980 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LYL1P12980 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LYL1P12980 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
LYL1P12980 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LYL1P12980 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LYL1P12980 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LYL1P12980 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
LYL1P12980 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
LYL1P12980 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LYL1P12980 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LYL1P12980 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LYL1P12980 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
LYL1P12980 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LYL1P12980 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms