Protein–RNA interactions for Protein: P0CW24

PNMA6A, Paraneoplastic antigen-like protein 6A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNMA6AP0CW24 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PNMA6AP0CW24 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PNMA6AP0CW24 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PNMA6AP0CW24 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PNMA6AP0CW24 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PNMA6AP0CW24 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PNMA6AP0CW24 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PNMA6AP0CW24 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PNMA6AP0CW24 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PNMA6AP0CW24 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PNMA6AP0CW24 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PNMA6AP0CW24 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PNMA6AP0CW24 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PNMA6AP0CW24 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PNMA6AP0CW24 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PNMA6AP0CW24 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PNMA6AP0CW24 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PNMA6AP0CW24 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PNMA6AP0CW24 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PNMA6AP0CW24 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PNMA6AP0CW24 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PNMA6AP0CW24 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PNMA6AP0CW24 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PNMA6AP0CW24 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PNMA6AP0CW24 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PNMA6AP0CW24 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PNMA6AP0CW24 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PNMA6AP0CW24 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PNMA6AP0CW24 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PNMA6AP0CW24 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PNMA6AP0CW24 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PNMA6AP0CW24 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PNMA6AP0CW24 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PNMA6AP0CW24 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PNMA6AP0CW24 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PNMA6AP0CW24 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PNMA6AP0CW24 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PNMA6AP0CW24 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PNMA6AP0CW24 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PNMA6AP0CW24 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PNMA6AP0CW24 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PNMA6AP0CW24 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PNMA6AP0CW24 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PNMA6AP0CW24 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PNMA6AP0CW24 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PNMA6AP0CW24 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PNMA6AP0CW24 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PNMA6AP0CW24 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PNMA6AP0CW24 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PNMA6AP0CW24 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PNMA6AP0CW24 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PNMA6AP0CW24 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PNMA6AP0CW24 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PNMA6AP0CW24 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PNMA6AP0CW24 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PNMA6AP0CW24 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PNMA6AP0CW24 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PNMA6AP0CW24 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PNMA6AP0CW24 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PNMA6AP0CW24 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PNMA6AP0CW24 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PNMA6AP0CW24 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PNMA6AP0CW24 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PNMA6AP0CW24 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PNMA6AP0CW24 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PNMA6AP0CW24 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PNMA6AP0CW24 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PNMA6AP0CW24 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PNMA6AP0CW24 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PNMA6AP0CW24 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PNMA6AP0CW24 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PNMA6AP0CW24 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PNMA6AP0CW24 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PNMA6AP0CW24 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PNMA6AP0CW24 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PNMA6AP0CW24 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PNMA6AP0CW24 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PNMA6AP0CW24 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PNMA6AP0CW24 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PNMA6AP0CW24 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PNMA6AP0CW24 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PNMA6AP0CW24 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PNMA6AP0CW24 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PNMA6AP0CW24 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PNMA6AP0CW24 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PNMA6AP0CW24 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PNMA6AP0CW24 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PNMA6AP0CW24 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PNMA6AP0CW24 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PNMA6AP0CW24 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PNMA6AP0CW24 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PNMA6AP0CW24 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PNMA6AP0CW24 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PNMA6AP0CW24 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PNMA6AP0CW24 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PNMA6AP0CW24 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PNMA6AP0CW24 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PNMA6AP0CW24 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PNMA6AP0CW24 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PNMA6AP0CW24 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms