Protein–RNA interactions for Protein: P07199

CENPB, Major centromere autoantigen B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPBP07199 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC27.89■■■□□ 2.05
CENPBP07199 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
CENPBP07199 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CENPBP07199 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CENPBP07199 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CENPBP07199 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CENPBP07199 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CENPBP07199 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CENPBP07199 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CENPBP07199 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CENPBP07199 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CENPBP07199 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CENPBP07199 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CENPBP07199 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CENPBP07199 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CENPBP07199 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
CENPBP07199 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CENPBP07199 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CENPBP07199 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CENPBP07199 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CENPBP07199 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CENPBP07199 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CENPBP07199 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CENPBP07199 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CENPBP07199 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
CENPBP07199 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CENPBP07199 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CENPBP07199 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CENPBP07199 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CENPBP07199 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CENPBP07199 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CENPBP07199 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CENPBP07199 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CENPBP07199 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CENPBP07199 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CENPBP07199 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CENPBP07199 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CENPBP07199 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CENPBP07199 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CENPBP07199 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CENPBP07199 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CENPBP07199 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CENPBP07199 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CENPBP07199 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
CENPBP07199 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CENPBP07199 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CENPBP07199 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CENPBP07199 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CENPBP07199 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CENPBP07199 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
CENPBP07199 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CENPBP07199 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CENPBP07199 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CENPBP07199 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CENPBP07199 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CENPBP07199 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CENPBP07199 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CENPBP07199 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CENPBP07199 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CENPBP07199 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CENPBP07199 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CENPBP07199 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CENPBP07199 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
CENPBP07199 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CENPBP07199 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CENPBP07199 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CENPBP07199 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CENPBP07199 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CENPBP07199 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CENPBP07199 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CENPBP07199 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CENPBP07199 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CENPBP07199 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
CENPBP07199 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CENPBP07199 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CENPBP07199 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CENPBP07199 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CENPBP07199 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CENPBP07199 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CENPBP07199 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CENPBP07199 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CENPBP07199 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CENPBP07199 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CENPBP07199 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CENPBP07199 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.04
CENPBP07199 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
CENPBP07199 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.04
CENPBP07199 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CENPBP07199 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
CENPBP07199 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CENPBP07199 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CENPBP07199 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CENPBP07199 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CENPBP07199 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CENPBP07199 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CENPBP07199 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CENPBP07199 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CENPBP07199 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CENPBP07199 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CENPBP07199 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms