Protein–RNA interactions for Protein: P04004

VTN, Vitronectin, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VTNP04004 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
VTNP04004 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
VTNP04004 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
VTNP04004 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
VTNP04004 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
VTNP04004 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
VTNP04004 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
VTNP04004 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
VTNP04004 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
VTNP04004 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
VTNP04004 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
VTNP04004 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
VTNP04004 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
VTNP04004 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
VTNP04004 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
VTNP04004 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
VTNP04004 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
VTNP04004 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
VTNP04004 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
VTNP04004 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
VTNP04004 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
VTNP04004 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
VTNP04004 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
VTNP04004 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
VTNP04004 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
VTNP04004 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
VTNP04004 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
VTNP04004 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
VTNP04004 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
VTNP04004 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
VTNP04004 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
VTNP04004 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
VTNP04004 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
VTNP04004 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
VTNP04004 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
VTNP04004 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
VTNP04004 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
VTNP04004 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
VTNP04004 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
VTNP04004 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
VTNP04004 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
VTNP04004 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
VTNP04004 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
VTNP04004 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
VTNP04004 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
VTNP04004 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
VTNP04004 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
VTNP04004 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
VTNP04004 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
VTNP04004 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
VTNP04004 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
VTNP04004 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
VTNP04004 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
VTNP04004 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
VTNP04004 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
VTNP04004 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
VTNP04004 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
VTNP04004 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
VTNP04004 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
VTNP04004 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
VTNP04004 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
VTNP04004 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
VTNP04004 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
VTNP04004 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
VTNP04004 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
VTNP04004 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
VTNP04004 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
VTNP04004 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
VTNP04004 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
VTNP04004 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
VTNP04004 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
VTNP04004 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
VTNP04004 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
VTNP04004 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
VTNP04004 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
VTNP04004 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
VTNP04004 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
VTNP04004 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
VTNP04004 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
VTNP04004 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
VTNP04004 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
VTNP04004 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
VTNP04004 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
VTNP04004 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
VTNP04004 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
VTNP04004 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
VTNP04004 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
VTNP04004 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
VTNP04004 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
VTNP04004 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
VTNP04004 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
VTNP04004 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
VTNP04004 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
VTNP04004 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
VTNP04004 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
VTNP04004 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
VTNP04004 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
VTNP04004 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
VTNP04004 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
VTNP04004 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms