Protein–RNA interactions for Protein: P02656

APOC3, Apolipoprotein C-III, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC3P02656 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOC3P02656 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOC3P02656 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOC3P02656 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOC3P02656 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOC3P02656 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOC3P02656 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOC3P02656 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
APOC3P02656 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
APOC3P02656 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
APOC3P02656 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
APOC3P02656 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
APOC3P02656 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
APOC3P02656 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
APOC3P02656 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
APOC3P02656 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
APOC3P02656 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
APOC3P02656 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
APOC3P02656 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
APOC3P02656 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
APOC3P02656 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
APOC3P02656 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
APOC3P02656 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
APOC3P02656 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
APOC3P02656 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
APOC3P02656 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
APOC3P02656 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
APOC3P02656 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
APOC3P02656 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
APOC3P02656 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
APOC3P02656 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
APOC3P02656 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
APOC3P02656 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
APOC3P02656 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
APOC3P02656 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
APOC3P02656 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
APOC3P02656 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
APOC3P02656 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
APOC3P02656 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
APOC3P02656 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
APOC3P02656 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
APOC3P02656 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
APOC3P02656 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
APOC3P02656 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
APOC3P02656 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
APOC3P02656 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
APOC3P02656 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
APOC3P02656 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
APOC3P02656 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
APOC3P02656 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
APOC3P02656 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
APOC3P02656 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
APOC3P02656 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
APOC3P02656 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
APOC3P02656 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
APOC3P02656 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
APOC3P02656 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
APOC3P02656 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
APOC3P02656 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
APOC3P02656 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
APOC3P02656 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
APOC3P02656 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
APOC3P02656 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
APOC3P02656 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
APOC3P02656 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
APOC3P02656 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
APOC3P02656 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
APOC3P02656 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
APOC3P02656 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
APOC3P02656 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOC3P02656 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOC3P02656 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOC3P02656 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOC3P02656 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOC3P02656 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOC3P02656 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOC3P02656 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOC3P02656 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOC3P02656 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOC3P02656 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOC3P02656 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOC3P02656 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOC3P02656 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOC3P02656 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOC3P02656 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOC3P02656 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOC3P02656 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOC3P02656 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOC3P02656 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOC3P02656 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOC3P02656 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOC3P02656 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOC3P02656 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOC3P02656 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOC3P02656 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOC3P02656 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOC3P02656 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOC3P02656 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOC3P02656 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOC3P02656 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms