Protein–RNA interactions for Protein: O95721

SNAP29, Synaptosomal-associated protein 29, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAP29O95721 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SNAP29O95721 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SNAP29O95721 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SNAP29O95721 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SNAP29O95721 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SNAP29O95721 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SNAP29O95721 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SNAP29O95721 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SNAP29O95721 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SNAP29O95721 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SNAP29O95721 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SNAP29O95721 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SNAP29O95721 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SNAP29O95721 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SNAP29O95721 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SNAP29O95721 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SNAP29O95721 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SNAP29O95721 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SNAP29O95721 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SNAP29O95721 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SNAP29O95721 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SNAP29O95721 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SNAP29O95721 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SNAP29O95721 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SNAP29O95721 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SNAP29O95721 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SNAP29O95721 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SNAP29O95721 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SNAP29O95721 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SNAP29O95721 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SNAP29O95721 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SNAP29O95721 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SNAP29O95721 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SNAP29O95721 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SNAP29O95721 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SNAP29O95721 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SNAP29O95721 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SNAP29O95721 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SNAP29O95721 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SNAP29O95721 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SNAP29O95721 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SNAP29O95721 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SNAP29O95721 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SNAP29O95721 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SNAP29O95721 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
SNAP29O95721 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SNAP29O95721 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SNAP29O95721 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SNAP29O95721 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SNAP29O95721 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SNAP29O95721 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SNAP29O95721 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SNAP29O95721 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SNAP29O95721 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SNAP29O95721 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SNAP29O95721 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SNAP29O95721 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SNAP29O95721 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SNAP29O95721 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SNAP29O95721 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SNAP29O95721 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SNAP29O95721 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SNAP29O95721 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SNAP29O95721 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SNAP29O95721 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SNAP29O95721 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SNAP29O95721 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SNAP29O95721 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SNAP29O95721 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SNAP29O95721 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SNAP29O95721 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SNAP29O95721 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SNAP29O95721 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SNAP29O95721 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SNAP29O95721 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SNAP29O95721 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SNAP29O95721 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
SNAP29O95721 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SNAP29O95721 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SNAP29O95721 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SNAP29O95721 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SNAP29O95721 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SNAP29O95721 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SNAP29O95721 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SNAP29O95721 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SNAP29O95721 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SNAP29O95721 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SNAP29O95721 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SNAP29O95721 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SNAP29O95721 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SNAP29O95721 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SNAP29O95721 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SNAP29O95721 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SNAP29O95721 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SNAP29O95721 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SNAP29O95721 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SNAP29O95721 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SNAP29O95721 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SNAP29O95721 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SNAP29O95721 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms