Protein–RNA interactions for Protein: O75923

DYSF, Dysferlin, humanhuman

Predictions only

Length 2,080 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DYSFO75923 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
DYSFO75923 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
DYSFO75923 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
DYSFO75923 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
DYSFO75923 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
DYSFO75923 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
DYSFO75923 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
DYSFO75923 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
DYSFO75923 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
DYSFO75923 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
DYSFO75923 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
DYSFO75923 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
DYSFO75923 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
DYSFO75923 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
DYSFO75923 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
DYSFO75923 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
DYSFO75923 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
DYSFO75923 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
DYSFO75923 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
DYSFO75923 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
DYSFO75923 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
DYSFO75923 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
DYSFO75923 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
DYSFO75923 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
DYSFO75923 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
DYSFO75923 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
DYSFO75923 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
DYSFO75923 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
DYSFO75923 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
DYSFO75923 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
DYSFO75923 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
DYSFO75923 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
DYSFO75923 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
DYSFO75923 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
DYSFO75923 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
DYSFO75923 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
DYSFO75923 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
DYSFO75923 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
DYSFO75923 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
DYSFO75923 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
DYSFO75923 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
DYSFO75923 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
DYSFO75923 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
DYSFO75923 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
DYSFO75923 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
DYSFO75923 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
DYSFO75923 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
DYSFO75923 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
DYSFO75923 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
DYSFO75923 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
DYSFO75923 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
DYSFO75923 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
DYSFO75923 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
DYSFO75923 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
DYSFO75923 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
DYSFO75923 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
DYSFO75923 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
DYSFO75923 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.33
DYSFO75923 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
DYSFO75923 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
DYSFO75923 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
DYSFO75923 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
DYSFO75923 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
DYSFO75923 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
DYSFO75923 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
DYSFO75923 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
DYSFO75923 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
DYSFO75923 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
DYSFO75923 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
DYSFO75923 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
DYSFO75923 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
DYSFO75923 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
DYSFO75923 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
DYSFO75923 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
DYSFO75923 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
DYSFO75923 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
DYSFO75923 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
DYSFO75923 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
DYSFO75923 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
DYSFO75923 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DYSFO75923 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DYSFO75923 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
DYSFO75923 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DYSFO75923 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DYSFO75923 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DYSFO75923 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
DYSFO75923 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DYSFO75923 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
DYSFO75923 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
DYSFO75923 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DYSFO75923 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DYSFO75923 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
DYSFO75923 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
DYSFO75923 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
DYSFO75923 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
DYSFO75923 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
DYSFO75923 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
DYSFO75923 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
DYSFO75923 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
DYSFO75923 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms