Protein–RNA interactions for Protein: O75533

SF3B1, Splicing factor 3B subunit 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B1O75533 AGPAT3-204ENST00000398061 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.247e-7■■■■■ 154.3
SF3B1O75533 EVI5-208ENST00000540033 7436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.781e-6■■■■■ 154.2
SF3B1O75533 EVI5-201ENST00000370331 7403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.811e-6■■■■■ 154.2
SF3B1O75533 ASCC3-204ENST00000369162 8146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.653e-6■■■■■ 154.2
SF3B1O75533 SGK3-210ENST00000521960 537 ntTSL 424.7■■□□□ 1.542e-6■■■■■ 154
SF3B1O75533 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.976e-7■■■■■ 154
SF3B1O75533 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.716e-7■■■■■ 154
SF3B1O75533 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.382e-6■■■■■ 154
SF3B1O75533 SGK3-212ENST00000522629 666 ntTSL 317.43■□□□□ 0.382e-6■■■■■ 154
SF3B1O75533 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.162e-6■■■■■ 154
SF3B1O75533 SGK3-208ENST00000521198 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.042e-6■■■■■ 154
SF3B1O75533 SGK3-202ENST00000396596 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.482e-6■■■■■ 154
SF3B1O75533 SGK3-201ENST00000345714 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.272e-6■■■■■ 154
SF3B1O75533 SGK3-207ENST00000521152 517 ntTSL 35.01□□□□□ -1.612e-6■■■■■ 154
SF3B1O75533 SGK3-205ENST00000519396 477 ntTSL 32.71□□□□□ -1.982e-6■■■■■ 154
SF3B1O75533 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.633e-8■■■■■ 153.8
SF3B1O75533 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.643e-8■■■■■ 153.8
SF3B1O75533 AKAP17A-203ENST00000474361 3232 ntTSL 1 (best)18.92■□□□□ 0.623e-8■■■■■ 153.8
SF3B1O75533 NDUFS8-208ENST00000526446 814 ntTSL 519.29■□□□□ 0.682e-6■■■■■ 153.7
SF3B1O75533 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.362e-6■■■■■ 153.7
SF3B1O75533 USP36-207ENST00000587010 607 ntTSL 315.68■□□□□ 0.16e-7■■■■■ 153.7
SF3B1O75533 ATP13A1-207ENST00000473243 4729 ntTSL 215.06■□□□□ 04e-6■■■■■ 153.7
SF3B1O75533 NDUFS8-207ENST00000526339 689 ntTSL 215.03■□□□□ -02e-6■■■■■ 153.7
SF3B1O75533 USP36-221ENST00000592231 2479 ntTSL 214.59□□□□□ -0.076e-7■■■■■ 153.7
SF3B1O75533 ATP13A1-214ENST00000497556 2442 ntTSL 214.4□□□□□ -0.14e-6■■■■■ 153.7
SF3B1O75533 ATP13A1-202ENST00000357324 3861 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.124e-6■■■■■ 153.7
SF3B1O75533 NDUFS8-210ENST00000528492 353 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.412e-6■■■■■ 153.7
SF3B1O75533 USP36-219ENST00000591052 427 ntTSL 311.09□□□□□ -0.636e-7■■■■■ 153.7
SF3B1O75533 ATP13A1-201ENST00000291503 3483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.644e-6■■■■■ 153.7
SF3B1O75533 USP36-208ENST00000587379 606 ntTSL 310.67□□□□□ -0.76e-7■■■■■ 153.7
SF3B1O75533 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.871e-6■■■■■ 153.7
SF3B1O75533 PLCB1-224ENST00000636319 2930 ntTSL 519.29■□□□□ 0.681e-6■■■■■ 153.7
SF3B1O75533 PLCB1-214ENST00000626161 706 ntTSL 517.64■□□□□ 0.411e-6■■■■■ 153.7
SF3B1O75533 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.241e-6■■■■■ 153.7
SF3B1O75533 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.241e-6■■■■■ 153.7
SF3B1O75533 PLCB1-218ENST00000629992 3095 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.131e-6■■■■■ 153.7
SF3B1O75533 PLCB1-202ENST00000378637 3864 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.371e-6■■■■■ 153.7
SF3B1O75533 PLCB1-220ENST00000630757 857 ntTSL 34.73□□□□□ -1.651e-6■■■■■ 153.7
SF3B1O75533 PLCB1-229ENST00000637204 100 ntTSL 51.56□□□□□ -2.161e-6■■■■■ 153.7
SF3B1O75533 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.412e-9■■■■■ 153.6
SF3B1O75533 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.392e-9■■■■■ 153.6
SF3B1O75533 POLD2-204ENST00000433715 765 ntTSL 322.78■■□□□ 1.242e-9■■■■■ 153.6
SF3B1O75533 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.932e-9■■■■■ 153.6
SF3B1O75533 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.912e-9■■■■■ 153.6
SF3B1O75533 POLD2-206ENST00000436844 854 ntTSL 519.88■□□□□ 0.772e-9■■■■■ 153.6
SF3B1O75533 POLD2-213ENST00000470867 678 ntTSL 518.33■□□□□ 0.532e-9■■■■■ 153.6
SF3B1O75533 POLD2-217ENST00000496539 571 ntTSL 217.62■□□□□ 0.412e-9■■■■■ 153.6
SF3B1O75533 POLD2-203ENST00000418438 556 ntTSL 416.7■□□□□ 0.262e-9■■■■■ 153.6
SF3B1O75533 POLD2-209ENST00000461116 420 ntTSL 215.66■□□□□ 0.12e-9■■■■■ 153.6
SF3B1O75533 POLD2-210ENST00000463464 707 ntTSL 212.71□□□□□ -0.372e-9■■■■■ 153.6
SF3B1O75533 POLD2-208ENST00000456038 665 ntTSL 311□□□□□ -0.652e-9■■■■■ 153.6
SF3B1O75533 GSK3A-203ENST00000453535 1897 ntTSL 529.2■■■□□ 2.272e-7■■■■■ 153
SF3B1O75533 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.972e-7■■■■■ 153
SF3B1O75533 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.622e-7■■■■■ 153
SF3B1O75533 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.342e-7■■■■■ 153
SF3B1O75533 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.032e-7■■■■■ 153
SF3B1O75533 MFSD1-218ENST00000491804 312 ntTSL 521.21■□□□□ 0.992e-7■■■■■ 153
SF3B1O75533 MFSD1-216ENST00000486568 566 ntTSL 420.45■□□□□ 0.862e-7■■■■■ 153
SF3B1O75533 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.692e-7■■■■■ 153
SF3B1O75533 THEM6-202ENST00000518798 2279 ntTSL 217.24■□□□□ 0.352e-7■■■■■ 153
SF3B1O75533 WDR97-206ENST00000534167 7119 ntTSL 1 (best)16.68■□□□□ 0.262e-7■■■■■ 153
SF3B1O75533 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.052e-7■■■■■ 153
SF3B1O75533 LAMB2-202ENST00000418109 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.082e-7■■■■■ 153
SF3B1O75533 THEM6-203ENST00000520217 551 ntTSL 314.43□□□□□ -0.12e-7■■■■■ 153
SF3B1O75533 LAMB2-201ENST00000305544 5643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.222e-7■■■■■ 153
SF3B1O75533 AP000446.1-201ENST00000530045 2643 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.842e-7■■■■■ 153
SF3B1O75533 GSK3A-202ENST00000398249 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.892e-7■■■■■ 153
SF3B1O75533 MFSD1-206ENST00000465739 639 ntTSL 57.1□□□□□ -1.272e-7■■■■■ 153
SF3B1O75533 CORO7-230ENST00000576437 1066 ntTSL 518.55■□□□□ 0.562e-6■■■■■ 152.9
SF3B1O75533 CORO7-223ENST00000574311 1737 ntTSL 518.46■□□□□ 0.552e-6■■■■■ 152.9
SF3B1O75533 CORO7-222ENST00000574025 2826 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.022e-6■■■■■ 152.9
SF3B1O75533 CORO7-201ENST00000251166 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.092e-6■■■■■ 152.9
SF3B1O75533 CORO7-227ENST00000575714 2978 ntTSL 513.79□□□□□ -0.22e-6■■■■■ 152.9
SF3B1O75533 CORO7-202ENST00000537233 3392 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.382e-6■■■■■ 152.9
SF3B1O75533 CORO7-208ENST00000571227 3578 ntTSL 512.58□□□□□ -0.392e-6■■■■■ 152.9
SF3B1O75533 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.141e-6■■■■■ 152.9
SF3B1O75533 DMPK-210ENST00000596686 2499 ntTSL 220.84■□□□□ 0.931e-6■■■■■ 152.9
SF3B1O75533 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.891e-6■■■■■ 152.9
SF3B1O75533 DMPK-214ENST00000598191 732 ntTSL 318.33■□□□□ 0.531e-6■■■■■ 152.9
SF3B1O75533 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.451e-6■■■■■ 152.9
SF3B1O75533 DMPK-211ENST00000596920 382 ntTSL 315.95■□□□□ 0.141e-6■■■■■ 152.9
SF3B1O75533 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.131e-6■■■■■ 152.9
SF3B1O75533 DMPK-219ENST00000600757 3357 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.071e-6■■■■■ 152.9
SF3B1O75533 SCLT1-202ENST00000439369 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.231e-6■■■■■ 152.9
SF3B1O75533 TPM3-202ENST00000302206 741 ntTSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.411e-6■■■■■ 152.9
SF3B1O75533 SCLT1-201ENST00000281142 3055 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.541e-6■■■■■ 152.9
SF3B1O75533 CCDC192-203ENST00000514853 1045 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.591e-6■■■■■ 152.9
SF3B1O75533 TPM3-218ENST00000505010 540 ntTSL 29.88□□□□□ -0.831e-6■■■■■ 152.9
SF3B1O75533 SCLT1-207ENST00000506233 3673 ntTSL 26.02□□□□□ -1.451e-6■■■■■ 152.9
SF3B1O75533 SCLT1-203ENST00000502495 1811 ntTSL 22.78□□□□□ -1.961e-6■■■■■ 152.9
SF3B1O75533 SREBF1-216ENST00000490796 698 ntTSL 221.77■■□□□ 1.071e-7■■■■■ 152.8
SF3B1O75533 SREBF1-207ENST00000447641 644 ntTSL 315.31■□□□□ 0.041e-7■■■■■ 152.8
SF3B1O75533 CTSD-209ENST00000637158 1200 ntTSL 520.22■□□□□ 0.836e-7■■■■■ 152.8
SF3B1O75533 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.656e-7■■■■■ 152.8
SF3B1O75533 CTSD-204ENST00000433655 2006 ntTSL 517.54■□□□□ 0.46e-7■■■■■ 152.8
SF3B1O75533 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.336e-7■■■■■ 152.8
SF3B1O75533 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.266e-7■■■■■ 152.8
SF3B1O75533 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.176e-7■■■■■ 152.8
SF3B1O75533 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.146e-7■■■■■ 152.8
SF3B1O75533 CTSD-208ENST00000636843 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.196e-7■■■■■ 152.8
Retrieved 100 of 46,956 protein–RNA pairs in 1112.8 ms