Protein–RNA interactions for Protein: O75113

N4BP1, NEDD4-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 896 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
N4BP1O75113 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
N4BP1O75113 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
N4BP1O75113 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
N4BP1O75113 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
N4BP1O75113 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
N4BP1O75113 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
N4BP1O75113 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
N4BP1O75113 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
N4BP1O75113 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
N4BP1O75113 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
N4BP1O75113 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
N4BP1O75113 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
N4BP1O75113 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
N4BP1O75113 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
N4BP1O75113 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
N4BP1O75113 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
N4BP1O75113 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
N4BP1O75113 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
N4BP1O75113 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
N4BP1O75113 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
N4BP1O75113 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
N4BP1O75113 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
N4BP1O75113 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
N4BP1O75113 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
N4BP1O75113 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
N4BP1O75113 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
N4BP1O75113 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
N4BP1O75113 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
N4BP1O75113 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
N4BP1O75113 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
N4BP1O75113 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
N4BP1O75113 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
N4BP1O75113 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
N4BP1O75113 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
N4BP1O75113 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
N4BP1O75113 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
N4BP1O75113 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
N4BP1O75113 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
N4BP1O75113 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
N4BP1O75113 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
N4BP1O75113 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
N4BP1O75113 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
N4BP1O75113 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
N4BP1O75113 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
N4BP1O75113 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
N4BP1O75113 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
N4BP1O75113 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
N4BP1O75113 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
N4BP1O75113 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
N4BP1O75113 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
N4BP1O75113 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
N4BP1O75113 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
N4BP1O75113 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
N4BP1O75113 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
N4BP1O75113 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
N4BP1O75113 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
N4BP1O75113 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
N4BP1O75113 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
N4BP1O75113 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
N4BP1O75113 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
N4BP1O75113 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
N4BP1O75113 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
N4BP1O75113 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
N4BP1O75113 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
N4BP1O75113 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
N4BP1O75113 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
N4BP1O75113 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
N4BP1O75113 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
N4BP1O75113 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
N4BP1O75113 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
N4BP1O75113 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
N4BP1O75113 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
N4BP1O75113 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
N4BP1O75113 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
N4BP1O75113 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
N4BP1O75113 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
N4BP1O75113 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
N4BP1O75113 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
N4BP1O75113 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
N4BP1O75113 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
N4BP1O75113 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
N4BP1O75113 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
N4BP1O75113 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
N4BP1O75113 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
N4BP1O75113 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
N4BP1O75113 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
N4BP1O75113 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
N4BP1O75113 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
N4BP1O75113 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
N4BP1O75113 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
N4BP1O75113 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
N4BP1O75113 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
N4BP1O75113 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
N4BP1O75113 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
N4BP1O75113 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
N4BP1O75113 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
N4BP1O75113 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
N4BP1O75113 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
N4BP1O75113 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
N4BP1O75113 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms