Protein–RNA interactions for Protein: O60494

CUBN, Cubilin, humanhuman

Predictions only

Length 3,623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUBNO60494 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CUBNO60494 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CUBNO60494 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CUBNO60494 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CUBNO60494 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CUBNO60494 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CUBNO60494 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CUBNO60494 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CUBNO60494 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CUBNO60494 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CUBNO60494 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CUBNO60494 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CUBNO60494 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CUBNO60494 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CUBNO60494 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CUBNO60494 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CUBNO60494 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CUBNO60494 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CUBNO60494 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CUBNO60494 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CUBNO60494 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CUBNO60494 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CUBNO60494 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CUBNO60494 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CUBNO60494 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CUBNO60494 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CUBNO60494 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CUBNO60494 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CUBNO60494 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CUBNO60494 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CUBNO60494 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CUBNO60494 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CUBNO60494 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CUBNO60494 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CUBNO60494 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CUBNO60494 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CUBNO60494 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CUBNO60494 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CUBNO60494 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CUBNO60494 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CUBNO60494 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CUBNO60494 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CUBNO60494 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CUBNO60494 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CUBNO60494 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CUBNO60494 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CUBNO60494 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CUBNO60494 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CUBNO60494 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CUBNO60494 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CUBNO60494 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CUBNO60494 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CUBNO60494 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CUBNO60494 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CUBNO60494 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CUBNO60494 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CUBNO60494 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CUBNO60494 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CUBNO60494 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CUBNO60494 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CUBNO60494 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CUBNO60494 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CUBNO60494 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CUBNO60494 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CUBNO60494 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CUBNO60494 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CUBNO60494 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CUBNO60494 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CUBNO60494 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CUBNO60494 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CUBNO60494 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CUBNO60494 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CUBNO60494 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CUBNO60494 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CUBNO60494 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CUBNO60494 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CUBNO60494 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CUBNO60494 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CUBNO60494 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CUBNO60494 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CUBNO60494 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CUBNO60494 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CUBNO60494 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CUBNO60494 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CUBNO60494 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CUBNO60494 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CUBNO60494 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CUBNO60494 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CUBNO60494 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CUBNO60494 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CUBNO60494 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CUBNO60494 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CUBNO60494 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CUBNO60494 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CUBNO60494 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CUBNO60494 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CUBNO60494 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CUBNO60494 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CUBNO60494 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CUBNO60494 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms