Protein–RNA interactions for Protein: O43581

SYT7, Synaptotagmin-7, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT7O43581 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SYT7O43581 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SYT7O43581 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SYT7O43581 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SYT7O43581 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SYT7O43581 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SYT7O43581 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SYT7O43581 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SYT7O43581 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SYT7O43581 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
SYT7O43581 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SYT7O43581 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
SYT7O43581 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SYT7O43581 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SYT7O43581 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SYT7O43581 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SYT7O43581 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SYT7O43581 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SYT7O43581 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SYT7O43581 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SYT7O43581 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SYT7O43581 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SYT7O43581 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SYT7O43581 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SYT7O43581 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SYT7O43581 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SYT7O43581 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SYT7O43581 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SYT7O43581 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SYT7O43581 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SYT7O43581 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SYT7O43581 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SYT7O43581 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SYT7O43581 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SYT7O43581 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SYT7O43581 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
SYT7O43581 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
SYT7O43581 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SYT7O43581 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SYT7O43581 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SYT7O43581 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SYT7O43581 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SYT7O43581 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SYT7O43581 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
SYT7O43581 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SYT7O43581 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SYT7O43581 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SYT7O43581 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SYT7O43581 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SYT7O43581 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SYT7O43581 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SYT7O43581 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SYT7O43581 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SYT7O43581 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SYT7O43581 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SYT7O43581 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SYT7O43581 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SYT7O43581 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SYT7O43581 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
SYT7O43581 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SYT7O43581 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SYT7O43581 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SYT7O43581 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SYT7O43581 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SYT7O43581 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SYT7O43581 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SYT7O43581 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SYT7O43581 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SYT7O43581 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SYT7O43581 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SYT7O43581 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SYT7O43581 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SYT7O43581 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SYT7O43581 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SYT7O43581 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SYT7O43581 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SYT7O43581 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SYT7O43581 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SYT7O43581 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SYT7O43581 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SYT7O43581 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SYT7O43581 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SYT7O43581 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SYT7O43581 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SYT7O43581 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SYT7O43581 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SYT7O43581 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SYT7O43581 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SYT7O43581 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
SYT7O43581 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SYT7O43581 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SYT7O43581 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SYT7O43581 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SYT7O43581 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SYT7O43581 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SYT7O43581 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SYT7O43581 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SYT7O43581 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SYT7O43581 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SYT7O43581 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms