Protein–RNA interactions for Protein: O43395

PRPF3, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF3O43395 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRPF3O43395 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRPF3O43395 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PRPF3O43395 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRPF3O43395 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRPF3O43395 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRPF3O43395 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRPF3O43395 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRPF3O43395 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRPF3O43395 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRPF3O43395 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRPF3O43395 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRPF3O43395 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRPF3O43395 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRPF3O43395 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRPF3O43395 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRPF3O43395 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRPF3O43395 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRPF3O43395 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRPF3O43395 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRPF3O43395 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PRPF3O43395 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRPF3O43395 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRPF3O43395 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRPF3O43395 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRPF3O43395 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRPF3O43395 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRPF3O43395 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRPF3O43395 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRPF3O43395 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PRPF3O43395 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRPF3O43395 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRPF3O43395 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRPF3O43395 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRPF3O43395 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRPF3O43395 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRPF3O43395 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRPF3O43395 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRPF3O43395 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRPF3O43395 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRPF3O43395 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRPF3O43395 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRPF3O43395 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRPF3O43395 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRPF3O43395 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRPF3O43395 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRPF3O43395 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PRPF3O43395 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRPF3O43395 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRPF3O43395 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRPF3O43395 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRPF3O43395 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRPF3O43395 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRPF3O43395 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRPF3O43395 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRPF3O43395 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRPF3O43395 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRPF3O43395 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRPF3O43395 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRPF3O43395 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRPF3O43395 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRPF3O43395 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRPF3O43395 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRPF3O43395 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRPF3O43395 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRPF3O43395 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PRPF3O43395 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRPF3O43395 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRPF3O43395 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRPF3O43395 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PRPF3O43395 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRPF3O43395 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRPF3O43395 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRPF3O43395 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRPF3O43395 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRPF3O43395 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRPF3O43395 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRPF3O43395 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRPF3O43395 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PRPF3O43395 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRPF3O43395 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRPF3O43395 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRPF3O43395 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRPF3O43395 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PRPF3O43395 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRPF3O43395 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRPF3O43395 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRPF3O43395 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRPF3O43395 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRPF3O43395 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRPF3O43395 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRPF3O43395 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRPF3O43395 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRPF3O43395 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PRPF3O43395 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PRPF3O43395 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PRPF3O43395 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PRPF3O43395 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
PRPF3O43395 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PRPF3O43395 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms