Protein–RNA interactions for Protein: O43186

CRX, Cone-rod homeobox protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 299 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRXO43186 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CRXO43186 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CRXO43186 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CRXO43186 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CRXO43186 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CRXO43186 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CRXO43186 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CRXO43186 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CRXO43186 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CRXO43186 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CRXO43186 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CRXO43186 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CRXO43186 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CRXO43186 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CRXO43186 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CRXO43186 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CRXO43186 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CRXO43186 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CRXO43186 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CRXO43186 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CRXO43186 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CRXO43186 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CRXO43186 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CRXO43186 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CRXO43186 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CRXO43186 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CRXO43186 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CRXO43186 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CRXO43186 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CRXO43186 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CRXO43186 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CRXO43186 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CRXO43186 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CRXO43186 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CRXO43186 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CRXO43186 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CRXO43186 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CRXO43186 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CRXO43186 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CRXO43186 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CRXO43186 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CRXO43186 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CRXO43186 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CRXO43186 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CRXO43186 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CRXO43186 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CRXO43186 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CRXO43186 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CRXO43186 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CRXO43186 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CRXO43186 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CRXO43186 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CRXO43186 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CRXO43186 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CRXO43186 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CRXO43186 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CRXO43186 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CRXO43186 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CRXO43186 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CRXO43186 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CRXO43186 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CRXO43186 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CRXO43186 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CRXO43186 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CRXO43186 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CRXO43186 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CRXO43186 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CRXO43186 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CRXO43186 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CRXO43186 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CRXO43186 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CRXO43186 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CRXO43186 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CRXO43186 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CRXO43186 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CRXO43186 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CRXO43186 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CRXO43186 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CRXO43186 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CRXO43186 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CRXO43186 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CRXO43186 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CRXO43186 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CRXO43186 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CRXO43186 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CRXO43186 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CRXO43186 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CRXO43186 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CRXO43186 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CRXO43186 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CRXO43186 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CRXO43186 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CRXO43186 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CRXO43186 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CRXO43186 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CRXO43186 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CRXO43186 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CRXO43186 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CRXO43186 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CRXO43186 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
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