Protein–RNA interactions for Protein: O00628

PEX7, Peroxisomal targeting signal 2 receptor, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX7O00628 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PEX7O00628 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PEX7O00628 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PEX7O00628 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PEX7O00628 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PEX7O00628 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PEX7O00628 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PEX7O00628 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PEX7O00628 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PEX7O00628 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PEX7O00628 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PEX7O00628 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PEX7O00628 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PEX7O00628 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PEX7O00628 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PEX7O00628 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PEX7O00628 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PEX7O00628 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PEX7O00628 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PEX7O00628 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PEX7O00628 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PEX7O00628 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PEX7O00628 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PEX7O00628 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PEX7O00628 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PEX7O00628 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PEX7O00628 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PEX7O00628 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PEX7O00628 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PEX7O00628 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PEX7O00628 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PEX7O00628 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PEX7O00628 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PEX7O00628 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PEX7O00628 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PEX7O00628 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PEX7O00628 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PEX7O00628 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PEX7O00628 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PEX7O00628 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PEX7O00628 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PEX7O00628 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PEX7O00628 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PEX7O00628 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PEX7O00628 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PEX7O00628 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PEX7O00628 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PEX7O00628 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PEX7O00628 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PEX7O00628 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PEX7O00628 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PEX7O00628 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PEX7O00628 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PEX7O00628 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PEX7O00628 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PEX7O00628 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PEX7O00628 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PEX7O00628 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PEX7O00628 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PEX7O00628 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PEX7O00628 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PEX7O00628 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PEX7O00628 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PEX7O00628 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PEX7O00628 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PEX7O00628 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PEX7O00628 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PEX7O00628 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PEX7O00628 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PEX7O00628 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PEX7O00628 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PEX7O00628 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PEX7O00628 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PEX7O00628 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PEX7O00628 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PEX7O00628 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PEX7O00628 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PEX7O00628 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PEX7O00628 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PEX7O00628 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PEX7O00628 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PEX7O00628 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PEX7O00628 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PEX7O00628 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PEX7O00628 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PEX7O00628 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PEX7O00628 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PEX7O00628 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PEX7O00628 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PEX7O00628 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PEX7O00628 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PEX7O00628 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PEX7O00628 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PEX7O00628 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PEX7O00628 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PEX7O00628 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PEX7O00628 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PEX7O00628 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PEX7O00628 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PEX7O00628 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms