Protein–RNA interactions for Protein: E7EW31

PROB1, Proline-rich basic protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,015 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PROB1E7EW31 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PROB1E7EW31 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PROB1E7EW31 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PROB1E7EW31 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PROB1E7EW31 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PROB1E7EW31 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PROB1E7EW31 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
PROB1E7EW31 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PROB1E7EW31 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PROB1E7EW31 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PROB1E7EW31 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PROB1E7EW31 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PROB1E7EW31 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
PROB1E7EW31 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
PROB1E7EW31 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PROB1E7EW31 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PROB1E7EW31 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PROB1E7EW31 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PROB1E7EW31 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PROB1E7EW31 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PROB1E7EW31 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PROB1E7EW31 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
PROB1E7EW31 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PROB1E7EW31 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PROB1E7EW31 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PROB1E7EW31 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PROB1E7EW31 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PROB1E7EW31 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PROB1E7EW31 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PROB1E7EW31 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PROB1E7EW31 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PROB1E7EW31 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PROB1E7EW31 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PROB1E7EW31 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PROB1E7EW31 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PROB1E7EW31 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
PROB1E7EW31 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PROB1E7EW31 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PROB1E7EW31 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PROB1E7EW31 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PROB1E7EW31 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PROB1E7EW31 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PROB1E7EW31 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PROB1E7EW31 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
PROB1E7EW31 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PROB1E7EW31 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PROB1E7EW31 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PROB1E7EW31 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PROB1E7EW31 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PROB1E7EW31 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PROB1E7EW31 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PROB1E7EW31 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PROB1E7EW31 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PROB1E7EW31 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PROB1E7EW31 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
PROB1E7EW31 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PROB1E7EW31 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PROB1E7EW31 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PROB1E7EW31 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
PROB1E7EW31 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PROB1E7EW31 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PROB1E7EW31 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PROB1E7EW31 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PROB1E7EW31 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PROB1E7EW31 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PROB1E7EW31 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PROB1E7EW31 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PROB1E7EW31 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PROB1E7EW31 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PROB1E7EW31 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PROB1E7EW31 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PROB1E7EW31 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PROB1E7EW31 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PROB1E7EW31 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PROB1E7EW31 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PROB1E7EW31 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PROB1E7EW31 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PROB1E7EW31 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PROB1E7EW31 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PROB1E7EW31 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
PROB1E7EW31 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PROB1E7EW31 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PROB1E7EW31 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PROB1E7EW31 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PROB1E7EW31 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PROB1E7EW31 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PROB1E7EW31 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PROB1E7EW31 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
PROB1E7EW31 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
PROB1E7EW31 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PROB1E7EW31 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PROB1E7EW31 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PROB1E7EW31 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PROB1E7EW31 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PROB1E7EW31 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PROB1E7EW31 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PROB1E7EW31 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PROB1E7EW31 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PROB1E7EW31 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PROB1E7EW31 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms