Protein–RNA interactions for Protein: C9J069

C9orf172, Uncharacterized protein C9orf172, humanhuman

Predictions only

Length 976 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf172C9J069 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
C9orf172C9J069 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
C9orf172C9J069 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
C9orf172C9J069 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
C9orf172C9J069 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
C9orf172C9J069 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
C9orf172C9J069 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
C9orf172C9J069 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
C9orf172C9J069 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
C9orf172C9J069 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
C9orf172C9J069 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
C9orf172C9J069 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
C9orf172C9J069 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
C9orf172C9J069 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
C9orf172C9J069 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
C9orf172C9J069 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
C9orf172C9J069 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
C9orf172C9J069 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
C9orf172C9J069 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
C9orf172C9J069 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
C9orf172C9J069 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
C9orf172C9J069 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
C9orf172C9J069 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
C9orf172C9J069 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
C9orf172C9J069 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
C9orf172C9J069 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
C9orf172C9J069 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
C9orf172C9J069 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
C9orf172C9J069 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
C9orf172C9J069 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
C9orf172C9J069 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
C9orf172C9J069 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
C9orf172C9J069 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
C9orf172C9J069 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
C9orf172C9J069 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
C9orf172C9J069 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
C9orf172C9J069 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
C9orf172C9J069 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
C9orf172C9J069 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
C9orf172C9J069 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
C9orf172C9J069 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
C9orf172C9J069 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
C9orf172C9J069 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
C9orf172C9J069 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
C9orf172C9J069 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
C9orf172C9J069 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
C9orf172C9J069 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
C9orf172C9J069 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
C9orf172C9J069 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
C9orf172C9J069 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
C9orf172C9J069 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
C9orf172C9J069 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
C9orf172C9J069 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
C9orf172C9J069 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
C9orf172C9J069 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
C9orf172C9J069 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
C9orf172C9J069 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
C9orf172C9J069 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
C9orf172C9J069 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
C9orf172C9J069 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
C9orf172C9J069 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
C9orf172C9J069 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
C9orf172C9J069 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
C9orf172C9J069 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
C9orf172C9J069 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
C9orf172C9J069 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
C9orf172C9J069 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
C9orf172C9J069 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
C9orf172C9J069 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
C9orf172C9J069 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
C9orf172C9J069 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
C9orf172C9J069 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
C9orf172C9J069 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
C9orf172C9J069 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
C9orf172C9J069 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
C9orf172C9J069 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
C9orf172C9J069 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
C9orf172C9J069 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
C9orf172C9J069 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
C9orf172C9J069 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
C9orf172C9J069 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
C9orf172C9J069 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
C9orf172C9J069 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
C9orf172C9J069 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
C9orf172C9J069 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
C9orf172C9J069 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
C9orf172C9J069 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
C9orf172C9J069 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
C9orf172C9J069 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
C9orf172C9J069 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
C9orf172C9J069 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
C9orf172C9J069 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
C9orf172C9J069 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
C9orf172C9J069 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
C9orf172C9J069 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
C9orf172C9J069 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
C9orf172C9J069 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
C9orf172C9J069 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
C9orf172C9J069 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
C9orf172C9J069 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms