Protein–RNA interactions for Protein: B7Z8K6

TRDC, T-cell receptor delta chain C region, humanhuman

Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDCB7Z8K6 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRDCB7Z8K6 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRDCB7Z8K6 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRDCB7Z8K6 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRDCB7Z8K6 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRDCB7Z8K6 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRDCB7Z8K6 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
TRDCB7Z8K6 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
TRDCB7Z8K6 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRDCB7Z8K6 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRDCB7Z8K6 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRDCB7Z8K6 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRDCB7Z8K6 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRDCB7Z8K6 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRDCB7Z8K6 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRDCB7Z8K6 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRDCB7Z8K6 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRDCB7Z8K6 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRDCB7Z8K6 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRDCB7Z8K6 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRDCB7Z8K6 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRDCB7Z8K6 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRDCB7Z8K6 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRDCB7Z8K6 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRDCB7Z8K6 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRDCB7Z8K6 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRDCB7Z8K6 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRDCB7Z8K6 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRDCB7Z8K6 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRDCB7Z8K6 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRDCB7Z8K6 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRDCB7Z8K6 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRDCB7Z8K6 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRDCB7Z8K6 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRDCB7Z8K6 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRDCB7Z8K6 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRDCB7Z8K6 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRDCB7Z8K6 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRDCB7Z8K6 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRDCB7Z8K6 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRDCB7Z8K6 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRDCB7Z8K6 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRDCB7Z8K6 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRDCB7Z8K6 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRDCB7Z8K6 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRDCB7Z8K6 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRDCB7Z8K6 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRDCB7Z8K6 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRDCB7Z8K6 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
TRDCB7Z8K6 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRDCB7Z8K6 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
TRDCB7Z8K6 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRDCB7Z8K6 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRDCB7Z8K6 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
TRDCB7Z8K6 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRDCB7Z8K6 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRDCB7Z8K6 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRDCB7Z8K6 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRDCB7Z8K6 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
TRDCB7Z8K6 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
TRDCB7Z8K6 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
TRDCB7Z8K6 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
TRDCB7Z8K6 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRDCB7Z8K6 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRDCB7Z8K6 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRDCB7Z8K6 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRDCB7Z8K6 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRDCB7Z8K6 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRDCB7Z8K6 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRDCB7Z8K6 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRDCB7Z8K6 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRDCB7Z8K6 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRDCB7Z8K6 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRDCB7Z8K6 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRDCB7Z8K6 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
TRDCB7Z8K6 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRDCB7Z8K6 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRDCB7Z8K6 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRDCB7Z8K6 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRDCB7Z8K6 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
TRDCB7Z8K6 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRDCB7Z8K6 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRDCB7Z8K6 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRDCB7Z8K6 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRDCB7Z8K6 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRDCB7Z8K6 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRDCB7Z8K6 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRDCB7Z8K6 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRDCB7Z8K6 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRDCB7Z8K6 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRDCB7Z8K6 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRDCB7Z8K6 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRDCB7Z8K6 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRDCB7Z8K6 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRDCB7Z8K6 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRDCB7Z8K6 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRDCB7Z8K6 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRDCB7Z8K6 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRDCB7Z8K6 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRDCB7Z8K6 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms