Protein–RNA interactions for Protein: B4DEV8

Proteasome subunit alpha type, humanhuman

Predictions only

Length 164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4DEV8 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
B4DEV8 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
B4DEV8 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
B4DEV8 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
B4DEV8 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
B4DEV8 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
B4DEV8 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
B4DEV8 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
B4DEV8 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
B4DEV8 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
B4DEV8 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
B4DEV8 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
B4DEV8 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
B4DEV8 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
B4DEV8 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
B4DEV8 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
B4DEV8 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
B4DEV8 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
B4DEV8 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
B4DEV8 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
B4DEV8 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
B4DEV8 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
B4DEV8 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
B4DEV8 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
B4DEV8 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
B4DEV8 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
B4DEV8 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
B4DEV8 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
B4DEV8 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
B4DEV8 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
B4DEV8 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
B4DEV8 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
B4DEV8 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
B4DEV8 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
B4DEV8 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
B4DEV8 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
B4DEV8 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
B4DEV8 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
B4DEV8 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
B4DEV8 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
B4DEV8 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
B4DEV8 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
B4DEV8 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
B4DEV8 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
B4DEV8 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
B4DEV8 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
B4DEV8 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
B4DEV8 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
B4DEV8 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
B4DEV8 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
B4DEV8 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
B4DEV8 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
B4DEV8 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
B4DEV8 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
B4DEV8 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
B4DEV8 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
B4DEV8 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
B4DEV8 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
B4DEV8 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
B4DEV8 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
B4DEV8 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
B4DEV8 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
B4DEV8 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
B4DEV8 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
B4DEV8 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
B4DEV8 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
B4DEV8 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
B4DEV8 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
B4DEV8 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
B4DEV8 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
B4DEV8 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
B4DEV8 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
B4DEV8 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
B4DEV8 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
B4DEV8 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
B4DEV8 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
B4DEV8 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
B4DEV8 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
B4DEV8 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
B4DEV8 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
B4DEV8 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
B4DEV8 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
B4DEV8 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
B4DEV8 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
B4DEV8 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
B4DEV8 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
B4DEV8 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
B4DEV8 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
B4DEV8 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
B4DEV8 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
B4DEV8 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
B4DEV8 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
B4DEV8 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
B4DEV8 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
B4DEV8 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
B4DEV8 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
B4DEV8 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
B4DEV8 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
B4DEV8 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
B4DEV8 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms