Protein–RNA interactions for Protein: A6NH52

TVP23A, Golgi apparatus membrane protein TVP23 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TVP23AA6NH52 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TVP23AA6NH52 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TVP23AA6NH52 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TVP23AA6NH52 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TVP23AA6NH52 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TVP23AA6NH52 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TVP23AA6NH52 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TVP23AA6NH52 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TVP23AA6NH52 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TVP23AA6NH52 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TVP23AA6NH52 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TVP23AA6NH52 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TVP23AA6NH52 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TVP23AA6NH52 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TVP23AA6NH52 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TVP23AA6NH52 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TVP23AA6NH52 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TVP23AA6NH52 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TVP23AA6NH52 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TVP23AA6NH52 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TVP23AA6NH52 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TVP23AA6NH52 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TVP23AA6NH52 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TVP23AA6NH52 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TVP23AA6NH52 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TVP23AA6NH52 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TVP23AA6NH52 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TVP23AA6NH52 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
TVP23AA6NH52 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TVP23AA6NH52 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TVP23AA6NH52 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TVP23AA6NH52 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TVP23AA6NH52 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TVP23AA6NH52 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TVP23AA6NH52 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TVP23AA6NH52 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TVP23AA6NH52 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TVP23AA6NH52 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TVP23AA6NH52 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TVP23AA6NH52 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TVP23AA6NH52 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TVP23AA6NH52 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TVP23AA6NH52 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TVP23AA6NH52 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TVP23AA6NH52 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TVP23AA6NH52 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
TVP23AA6NH52 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TVP23AA6NH52 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TVP23AA6NH52 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TVP23AA6NH52 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TVP23AA6NH52 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TVP23AA6NH52 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TVP23AA6NH52 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TVP23AA6NH52 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TVP23AA6NH52 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TVP23AA6NH52 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TVP23AA6NH52 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TVP23AA6NH52 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TVP23AA6NH52 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TVP23AA6NH52 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TVP23AA6NH52 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TVP23AA6NH52 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TVP23AA6NH52 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TVP23AA6NH52 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TVP23AA6NH52 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TVP23AA6NH52 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TVP23AA6NH52 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TVP23AA6NH52 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
TVP23AA6NH52 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TVP23AA6NH52 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TVP23AA6NH52 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TVP23AA6NH52 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TVP23AA6NH52 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TVP23AA6NH52 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
TVP23AA6NH52 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TVP23AA6NH52 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TVP23AA6NH52 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TVP23AA6NH52 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TVP23AA6NH52 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TVP23AA6NH52 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TVP23AA6NH52 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TVP23AA6NH52 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TVP23AA6NH52 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TVP23AA6NH52 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TVP23AA6NH52 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TVP23AA6NH52 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TVP23AA6NH52 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TVP23AA6NH52 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TVP23AA6NH52 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TVP23AA6NH52 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TVP23AA6NH52 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TVP23AA6NH52 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TVP23AA6NH52 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TVP23AA6NH52 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TVP23AA6NH52 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TVP23AA6NH52 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TVP23AA6NH52 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TVP23AA6NH52 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TVP23AA6NH52 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TVP23AA6NH52 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms