Protein–RNA interactions for Protein: A6NFN3

RBFOX3, RNA binding protein fox-1 homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBFOX3A6NFN3 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RBFOX3A6NFN3 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RBFOX3A6NFN3 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RBFOX3A6NFN3 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RBFOX3A6NFN3 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
RBFOX3A6NFN3 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RBFOX3A6NFN3 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RBFOX3A6NFN3 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RBFOX3A6NFN3 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RBFOX3A6NFN3 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RBFOX3A6NFN3 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RBFOX3A6NFN3 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RBFOX3A6NFN3 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RBFOX3A6NFN3 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RBFOX3A6NFN3 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
RBFOX3A6NFN3 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RBFOX3A6NFN3 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RBFOX3A6NFN3 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RBFOX3A6NFN3 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RBFOX3A6NFN3 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RBFOX3A6NFN3 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RBFOX3A6NFN3 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RBFOX3A6NFN3 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RBFOX3A6NFN3 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RBFOX3A6NFN3 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RBFOX3A6NFN3 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RBFOX3A6NFN3 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RBFOX3A6NFN3 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RBFOX3A6NFN3 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RBFOX3A6NFN3 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RBFOX3A6NFN3 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RBFOX3A6NFN3 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RBFOX3A6NFN3 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RBFOX3A6NFN3 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RBFOX3A6NFN3 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
RBFOX3A6NFN3 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RBFOX3A6NFN3 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RBFOX3A6NFN3 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RBFOX3A6NFN3 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RBFOX3A6NFN3 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RBFOX3A6NFN3 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RBFOX3A6NFN3 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RBFOX3A6NFN3 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RBFOX3A6NFN3 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RBFOX3A6NFN3 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RBFOX3A6NFN3 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RBFOX3A6NFN3 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RBFOX3A6NFN3 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RBFOX3A6NFN3 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RBFOX3A6NFN3 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RBFOX3A6NFN3 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RBFOX3A6NFN3 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RBFOX3A6NFN3 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RBFOX3A6NFN3 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RBFOX3A6NFN3 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RBFOX3A6NFN3 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RBFOX3A6NFN3 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RBFOX3A6NFN3 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RBFOX3A6NFN3 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RBFOX3A6NFN3 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RBFOX3A6NFN3 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RBFOX3A6NFN3 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RBFOX3A6NFN3 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RBFOX3A6NFN3 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RBFOX3A6NFN3 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
RBFOX3A6NFN3 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
RBFOX3A6NFN3 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RBFOX3A6NFN3 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RBFOX3A6NFN3 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RBFOX3A6NFN3 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RBFOX3A6NFN3 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RBFOX3A6NFN3 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RBFOX3A6NFN3 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RBFOX3A6NFN3 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RBFOX3A6NFN3 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RBFOX3A6NFN3 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RBFOX3A6NFN3 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RBFOX3A6NFN3 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RBFOX3A6NFN3 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RBFOX3A6NFN3 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RBFOX3A6NFN3 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RBFOX3A6NFN3 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RBFOX3A6NFN3 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RBFOX3A6NFN3 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RBFOX3A6NFN3 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RBFOX3A6NFN3 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RBFOX3A6NFN3 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RBFOX3A6NFN3 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RBFOX3A6NFN3 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RBFOX3A6NFN3 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RBFOX3A6NFN3 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RBFOX3A6NFN3 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RBFOX3A6NFN3 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RBFOX3A6NFN3 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RBFOX3A6NFN3 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RBFOX3A6NFN3 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RBFOX3A6NFN3 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RBFOX3A6NFN3 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RBFOX3A6NFN3 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RBFOX3A6NFN3 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms