Protein–RNA interactions for Protein: A6NFI3

ZNF316, Zinc finger protein 316, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF316A6NFI3 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
ZNF316A6NFI3 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
ZNF316A6NFI3 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
ZNF316A6NFI3 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
ZNF316A6NFI3 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC28.89■■■□□ 2.22
ZNF316A6NFI3 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
ZNF316A6NFI3 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
ZNF316A6NFI3 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
ZNF316A6NFI3 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
ZNF316A6NFI3 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
ZNF316A6NFI3 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
ZNF316A6NFI3 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.21
ZNF316A6NFI3 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.21
ZNF316A6NFI3 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
ZNF316A6NFI3 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
ZNF316A6NFI3 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
ZNF316A6NFI3 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
ZNF316A6NFI3 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
ZNF316A6NFI3 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
ZNF316A6NFI3 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
ZNF316A6NFI3 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
ZNF316A6NFI3 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
ZNF316A6NFI3 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
ZNF316A6NFI3 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
ZNF316A6NFI3 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
ZNF316A6NFI3 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
ZNF316A6NFI3 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
ZNF316A6NFI3 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
ZNF316A6NFI3 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
ZNF316A6NFI3 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
ZNF316A6NFI3 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
ZNF316A6NFI3 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
ZNF316A6NFI3 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
ZNF316A6NFI3 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
ZNF316A6NFI3 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
ZNF316A6NFI3 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
ZNF316A6NFI3 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
ZNF316A6NFI3 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
ZNF316A6NFI3 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
ZNF316A6NFI3 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
ZNF316A6NFI3 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
ZNF316A6NFI3 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
ZNF316A6NFI3 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
ZNF316A6NFI3 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
ZNF316A6NFI3 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
ZNF316A6NFI3 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
ZNF316A6NFI3 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
ZNF316A6NFI3 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
ZNF316A6NFI3 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
ZNF316A6NFI3 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC28.86■■■□□ 2.21
ZNF316A6NFI3 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
ZNF316A6NFI3 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
ZNF316A6NFI3 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
ZNF316A6NFI3 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
ZNF316A6NFI3 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
ZNF316A6NFI3 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
ZNF316A6NFI3 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
ZNF316A6NFI3 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
ZNF316A6NFI3 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
ZNF316A6NFI3 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC28.85■■■□□ 2.21
ZNF316A6NFI3 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
ZNF316A6NFI3 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
ZNF316A6NFI3 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
ZNF316A6NFI3 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
ZNF316A6NFI3 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC28.85■■■□□ 2.21
ZNF316A6NFI3 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
ZNF316A6NFI3 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
ZNF316A6NFI3 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
ZNF316A6NFI3 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
ZNF316A6NFI3 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
ZNF316A6NFI3 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
ZNF316A6NFI3 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
ZNF316A6NFI3 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
ZNF316A6NFI3 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
ZNF316A6NFI3 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
ZNF316A6NFI3 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
ZNF316A6NFI3 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
ZNF316A6NFI3 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
ZNF316A6NFI3 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
ZNF316A6NFI3 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
ZNF316A6NFI3 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
ZNF316A6NFI3 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
ZNF316A6NFI3 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
ZNF316A6NFI3 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
ZNF316A6NFI3 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
ZNF316A6NFI3 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
ZNF316A6NFI3 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
ZNF316A6NFI3 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
ZNF316A6NFI3 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
ZNF316A6NFI3 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
ZNF316A6NFI3 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
ZNF316A6NFI3 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
ZNF316A6NFI3 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
ZNF316A6NFI3 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
ZNF316A6NFI3 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
ZNF316A6NFI3 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
ZNF316A6NFI3 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
ZNF316A6NFI3 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
ZNF316A6NFI3 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
ZNF316A6NFI3 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.5 ms