Protein–RNA interactions for Protein: A6NCW7

USP17L4, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L4A6NCW7 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
USP17L4A6NCW7 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
USP17L4A6NCW7 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
USP17L4A6NCW7 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
USP17L4A6NCW7 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
USP17L4A6NCW7 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
USP17L4A6NCW7 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
USP17L4A6NCW7 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
USP17L4A6NCW7 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
USP17L4A6NCW7 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
USP17L4A6NCW7 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
USP17L4A6NCW7 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
USP17L4A6NCW7 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
USP17L4A6NCW7 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
USP17L4A6NCW7 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
USP17L4A6NCW7 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
USP17L4A6NCW7 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
USP17L4A6NCW7 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
USP17L4A6NCW7 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
USP17L4A6NCW7 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
USP17L4A6NCW7 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
USP17L4A6NCW7 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
USP17L4A6NCW7 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
USP17L4A6NCW7 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
USP17L4A6NCW7 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
USP17L4A6NCW7 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
USP17L4A6NCW7 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
USP17L4A6NCW7 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
USP17L4A6NCW7 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
USP17L4A6NCW7 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
USP17L4A6NCW7 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
USP17L4A6NCW7 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
USP17L4A6NCW7 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
USP17L4A6NCW7 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
USP17L4A6NCW7 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
USP17L4A6NCW7 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
USP17L4A6NCW7 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
USP17L4A6NCW7 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
USP17L4A6NCW7 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
USP17L4A6NCW7 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
USP17L4A6NCW7 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
USP17L4A6NCW7 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
USP17L4A6NCW7 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
USP17L4A6NCW7 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
USP17L4A6NCW7 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
USP17L4A6NCW7 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
USP17L4A6NCW7 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
USP17L4A6NCW7 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
USP17L4A6NCW7 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
USP17L4A6NCW7 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
USP17L4A6NCW7 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
USP17L4A6NCW7 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
USP17L4A6NCW7 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
USP17L4A6NCW7 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
USP17L4A6NCW7 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
USP17L4A6NCW7 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
USP17L4A6NCW7 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
USP17L4A6NCW7 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
USP17L4A6NCW7 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
USP17L4A6NCW7 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
USP17L4A6NCW7 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
USP17L4A6NCW7 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
USP17L4A6NCW7 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
USP17L4A6NCW7 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
USP17L4A6NCW7 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
USP17L4A6NCW7 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
USP17L4A6NCW7 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
USP17L4A6NCW7 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
USP17L4A6NCW7 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
USP17L4A6NCW7 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
USP17L4A6NCW7 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
USP17L4A6NCW7 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
USP17L4A6NCW7 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
USP17L4A6NCW7 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
USP17L4A6NCW7 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
USP17L4A6NCW7 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
USP17L4A6NCW7 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
USP17L4A6NCW7 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
USP17L4A6NCW7 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
USP17L4A6NCW7 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
USP17L4A6NCW7 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
USP17L4A6NCW7 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
USP17L4A6NCW7 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
USP17L4A6NCW7 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
USP17L4A6NCW7 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
USP17L4A6NCW7 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
USP17L4A6NCW7 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
USP17L4A6NCW7 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
USP17L4A6NCW7 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
USP17L4A6NCW7 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
USP17L4A6NCW7 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
USP17L4A6NCW7 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
USP17L4A6NCW7 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
USP17L4A6NCW7 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
USP17L4A6NCW7 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
USP17L4A6NCW7 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
USP17L4A6NCW7 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
USP17L4A6NCW7 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
USP17L4A6NCW7 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
USP17L4A6NCW7 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms