Protein–RNA interactions for Protein: A4D1S5

RAB19, Ras-related protein Rab-19, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB19A4D1S5 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB19A4D1S5 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB19A4D1S5 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB19A4D1S5 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB19A4D1S5 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB19A4D1S5 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB19A4D1S5 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB19A4D1S5 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB19A4D1S5 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB19A4D1S5 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB19A4D1S5 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB19A4D1S5 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB19A4D1S5 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB19A4D1S5 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB19A4D1S5 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB19A4D1S5 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB19A4D1S5 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB19A4D1S5 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB19A4D1S5 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB19A4D1S5 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB19A4D1S5 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB19A4D1S5 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB19A4D1S5 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB19A4D1S5 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB19A4D1S5 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB19A4D1S5 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB19A4D1S5 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB19A4D1S5 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB19A4D1S5 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB19A4D1S5 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB19A4D1S5 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB19A4D1S5 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB19A4D1S5 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB19A4D1S5 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB19A4D1S5 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB19A4D1S5 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB19A4D1S5 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB19A4D1S5 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB19A4D1S5 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB19A4D1S5 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB19A4D1S5 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB19A4D1S5 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB19A4D1S5 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB19A4D1S5 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB19A4D1S5 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB19A4D1S5 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB19A4D1S5 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAB19A4D1S5 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAB19A4D1S5 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAB19A4D1S5 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAB19A4D1S5 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAB19A4D1S5 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAB19A4D1S5 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
RAB19A4D1S5 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAB19A4D1S5 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
RAB19A4D1S5 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAB19A4D1S5 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAB19A4D1S5 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAB19A4D1S5 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAB19A4D1S5 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAB19A4D1S5 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAB19A4D1S5 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAB19A4D1S5 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAB19A4D1S5 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAB19A4D1S5 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAB19A4D1S5 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAB19A4D1S5 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAB19A4D1S5 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAB19A4D1S5 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAB19A4D1S5 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAB19A4D1S5 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
RAB19A4D1S5 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
RAB19A4D1S5 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAB19A4D1S5 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAB19A4D1S5 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAB19A4D1S5 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAB19A4D1S5 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAB19A4D1S5 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAB19A4D1S5 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAB19A4D1S5 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAB19A4D1S5 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
RAB19A4D1S5 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAB19A4D1S5 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAB19A4D1S5 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAB19A4D1S5 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAB19A4D1S5 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAB19A4D1S5 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAB19A4D1S5 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB19A4D1S5 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB19A4D1S5 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB19A4D1S5 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB19A4D1S5 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB19A4D1S5 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB19A4D1S5 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB19A4D1S5 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB19A4D1S5 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB19A4D1S5 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB19A4D1S5 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB19A4D1S5 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB19A4D1S5 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms