Protein–RNA interactions for Protein: A2A3K4

PTPDC1, Protein tyrosine phosphatase domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 754 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPDC1A2A3K4 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTPDC1A2A3K4 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTPDC1A2A3K4 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTPDC1A2A3K4 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
PTPDC1A2A3K4 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTPDC1A2A3K4 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTPDC1A2A3K4 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTPDC1A2A3K4 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTPDC1A2A3K4 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTPDC1A2A3K4 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTPDC1A2A3K4 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTPDC1A2A3K4 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTPDC1A2A3K4 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTPDC1A2A3K4 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTPDC1A2A3K4 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTPDC1A2A3K4 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTPDC1A2A3K4 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTPDC1A2A3K4 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTPDC1A2A3K4 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTPDC1A2A3K4 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTPDC1A2A3K4 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTPDC1A2A3K4 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTPDC1A2A3K4 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTPDC1A2A3K4 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTPDC1A2A3K4 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTPDC1A2A3K4 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTPDC1A2A3K4 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTPDC1A2A3K4 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTPDC1A2A3K4 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTPDC1A2A3K4 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PTPDC1A2A3K4 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
PTPDC1A2A3K4 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PTPDC1A2A3K4 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PTPDC1A2A3K4 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
PTPDC1A2A3K4 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PTPDC1A2A3K4 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PTPDC1A2A3K4 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PTPDC1A2A3K4 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PTPDC1A2A3K4 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PTPDC1A2A3K4 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PTPDC1A2A3K4 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
PTPDC1A2A3K4 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PTPDC1A2A3K4 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PTPDC1A2A3K4 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PTPDC1A2A3K4 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PTPDC1A2A3K4 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PTPDC1A2A3K4 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTPDC1A2A3K4 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTPDC1A2A3K4 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTPDC1A2A3K4 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTPDC1A2A3K4 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTPDC1A2A3K4 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTPDC1A2A3K4 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTPDC1A2A3K4 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTPDC1A2A3K4 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTPDC1A2A3K4 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTPDC1A2A3K4 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTPDC1A2A3K4 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
PTPDC1A2A3K4 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTPDC1A2A3K4 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTPDC1A2A3K4 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTPDC1A2A3K4 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTPDC1A2A3K4 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTPDC1A2A3K4 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTPDC1A2A3K4 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTPDC1A2A3K4 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTPDC1A2A3K4 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTPDC1A2A3K4 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PTPDC1A2A3K4 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PTPDC1A2A3K4 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PTPDC1A2A3K4 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
PTPDC1A2A3K4 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PTPDC1A2A3K4 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PTPDC1A2A3K4 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PTPDC1A2A3K4 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PTPDC1A2A3K4 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PTPDC1A2A3K4 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PTPDC1A2A3K4 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PTPDC1A2A3K4 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PTPDC1A2A3K4 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PTPDC1A2A3K4 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PTPDC1A2A3K4 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
PTPDC1A2A3K4 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PTPDC1A2A3K4 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PTPDC1A2A3K4 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PTPDC1A2A3K4 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PTPDC1A2A3K4 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PTPDC1A2A3K4 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PTPDC1A2A3K4 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PTPDC1A2A3K4 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PTPDC1A2A3K4 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PTPDC1A2A3K4 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PTPDC1A2A3K4 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PTPDC1A2A3K4 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PTPDC1A2A3K4 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PTPDC1A2A3K4 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PTPDC1A2A3K4 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PTPDC1A2A3K4 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PTPDC1A2A3K4 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PTPDC1A2A3K4 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms