Protein–RNA interactions for Protein: V9GYV3

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 84 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
V9GYV3 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
V9GYV3 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
V9GYV3 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
V9GYV3 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
V9GYV3 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
V9GYV3 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
V9GYV3 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
V9GYV3 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
V9GYV3 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
V9GYV3 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
V9GYV3 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
V9GYV3 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
V9GYV3 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
V9GYV3 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
V9GYV3 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
V9GYV3 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
V9GYV3 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
V9GYV3 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
V9GYV3 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
V9GYV3 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
V9GYV3 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
V9GYV3 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
V9GYV3 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
V9GYV3 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
V9GYV3 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
V9GYV3 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
V9GYV3 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
V9GYV3 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
V9GYV3 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
V9GYV3 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
V9GYV3 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
V9GYV3 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
V9GYV3 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
V9GYV3 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
V9GYV3 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
V9GYV3 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
V9GYV3 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
V9GYV3 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
V9GYV3 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
V9GYV3 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
V9GYV3 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
V9GYV3 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
V9GYV3 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
V9GYV3 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
V9GYV3 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
V9GYV3 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
V9GYV3 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
V9GYV3 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
V9GYV3 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
V9GYV3 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
V9GYV3 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
V9GYV3 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
V9GYV3 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
V9GYV3 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
V9GYV3 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
V9GYV3 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
V9GYV3 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
V9GYV3 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
V9GYV3 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
V9GYV3 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
V9GYV3 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
V9GYV3 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
V9GYV3 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
V9GYV3 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
V9GYV3 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
V9GYV3 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
V9GYV3 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
V9GYV3 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
V9GYV3 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
V9GYV3 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
V9GYV3 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
V9GYV3 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
V9GYV3 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
V9GYV3 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
V9GYV3 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
V9GYV3 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
V9GYV3 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
V9GYV3 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
V9GYV3 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
V9GYV3 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
V9GYV3 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
V9GYV3 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
V9GYV3 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
V9GYV3 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
V9GYV3 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
V9GYV3 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
V9GYV3 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
V9GYV3 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
V9GYV3 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
V9GYV3 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
V9GYV3 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
V9GYV3 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
V9GYV3 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
V9GYV3 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
V9GYV3 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
V9GYV3 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
V9GYV3 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
V9GYV3 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
V9GYV3 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
V9GYV3 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms