Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5Q9

GTF3C3, General transcription factor 3C polypeptide 3, humanhuman

Predictions only

Length 886 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C3Q9Y5Q9 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
GTF3C3Q9Y5Q9 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
GTF3C3Q9Y5Q9 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
GTF3C3Q9Y5Q9 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
GTF3C3Q9Y5Q9 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
GTF3C3Q9Y5Q9 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
GTF3C3Q9Y5Q9 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
GTF3C3Q9Y5Q9 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
GTF3C3Q9Y5Q9 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
GTF3C3Q9Y5Q9 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
GTF3C3Q9Y5Q9 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
GTF3C3Q9Y5Q9 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
GTF3C3Q9Y5Q9 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
GTF3C3Q9Y5Q9 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
GTF3C3Q9Y5Q9 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
GTF3C3Q9Y5Q9 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
GTF3C3Q9Y5Q9 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
GTF3C3Q9Y5Q9 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
GTF3C3Q9Y5Q9 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
GTF3C3Q9Y5Q9 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
GTF3C3Q9Y5Q9 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
GTF3C3Q9Y5Q9 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
GTF3C3Q9Y5Q9 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
GTF3C3Q9Y5Q9 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
GTF3C3Q9Y5Q9 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
GTF3C3Q9Y5Q9 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
GTF3C3Q9Y5Q9 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
GTF3C3Q9Y5Q9 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
GTF3C3Q9Y5Q9 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
GTF3C3Q9Y5Q9 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
GTF3C3Q9Y5Q9 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
GTF3C3Q9Y5Q9 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
GTF3C3Q9Y5Q9 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
GTF3C3Q9Y5Q9 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
GTF3C3Q9Y5Q9 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
GTF3C3Q9Y5Q9 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
GTF3C3Q9Y5Q9 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
GTF3C3Q9Y5Q9 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
GTF3C3Q9Y5Q9 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
GTF3C3Q9Y5Q9 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
GTF3C3Q9Y5Q9 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
GTF3C3Q9Y5Q9 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
GTF3C3Q9Y5Q9 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
GTF3C3Q9Y5Q9 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
GTF3C3Q9Y5Q9 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
GTF3C3Q9Y5Q9 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
GTF3C3Q9Y5Q9 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
GTF3C3Q9Y5Q9 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
GTF3C3Q9Y5Q9 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
GTF3C3Q9Y5Q9 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
GTF3C3Q9Y5Q9 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
GTF3C3Q9Y5Q9 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
GTF3C3Q9Y5Q9 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
GTF3C3Q9Y5Q9 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
GTF3C3Q9Y5Q9 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
GTF3C3Q9Y5Q9 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
GTF3C3Q9Y5Q9 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
GTF3C3Q9Y5Q9 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
GTF3C3Q9Y5Q9 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
GTF3C3Q9Y5Q9 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
GTF3C3Q9Y5Q9 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
GTF3C3Q9Y5Q9 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
GTF3C3Q9Y5Q9 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
GTF3C3Q9Y5Q9 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
GTF3C3Q9Y5Q9 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
GTF3C3Q9Y5Q9 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
GTF3C3Q9Y5Q9 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
GTF3C3Q9Y5Q9 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
GTF3C3Q9Y5Q9 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC27.24■■□□□ 1.95
GTF3C3Q9Y5Q9 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
GTF3C3Q9Y5Q9 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
GTF3C3Q9Y5Q9 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
GTF3C3Q9Y5Q9 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
GTF3C3Q9Y5Q9 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
GTF3C3Q9Y5Q9 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
GTF3C3Q9Y5Q9 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
GTF3C3Q9Y5Q9 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
GTF3C3Q9Y5Q9 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
GTF3C3Q9Y5Q9 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
GTF3C3Q9Y5Q9 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
GTF3C3Q9Y5Q9 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
GTF3C3Q9Y5Q9 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
GTF3C3Q9Y5Q9 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
GTF3C3Q9Y5Q9 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
GTF3C3Q9Y5Q9 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
GTF3C3Q9Y5Q9 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
GTF3C3Q9Y5Q9 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
GTF3C3Q9Y5Q9 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
GTF3C3Q9Y5Q9 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
GTF3C3Q9Y5Q9 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
GTF3C3Q9Y5Q9 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
GTF3C3Q9Y5Q9 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
GTF3C3Q9Y5Q9 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
GTF3C3Q9Y5Q9 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
GTF3C3Q9Y5Q9 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
GTF3C3Q9Y5Q9 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
GTF3C3Q9Y5Q9 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
GTF3C3Q9Y5Q9 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
GTF3C3Q9Y5Q9 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
GTF3C3Q9Y5Q9 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms