Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4X4

KLF12, Krueppel-like factor 12, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF12Q9Y4X4 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLF12Q9Y4X4 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLF12Q9Y4X4 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLF12Q9Y4X4 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLF12Q9Y4X4 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLF12Q9Y4X4 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLF12Q9Y4X4 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLF12Q9Y4X4 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLF12Q9Y4X4 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLF12Q9Y4X4 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLF12Q9Y4X4 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLF12Q9Y4X4 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
KLF12Q9Y4X4 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
KLF12Q9Y4X4 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
KLF12Q9Y4X4 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
KLF12Q9Y4X4 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
KLF12Q9Y4X4 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLF12Q9Y4X4 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLF12Q9Y4X4 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLF12Q9Y4X4 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLF12Q9Y4X4 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLF12Q9Y4X4 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLF12Q9Y4X4 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLF12Q9Y4X4 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
KLF12Q9Y4X4 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
KLF12Q9Y4X4 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLF12Q9Y4X4 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLF12Q9Y4X4 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLF12Q9Y4X4 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLF12Q9Y4X4 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLF12Q9Y4X4 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLF12Q9Y4X4 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLF12Q9Y4X4 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLF12Q9Y4X4 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLF12Q9Y4X4 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLF12Q9Y4X4 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLF12Q9Y4X4 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
KLF12Q9Y4X4 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
KLF12Q9Y4X4 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLF12Q9Y4X4 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLF12Q9Y4X4 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLF12Q9Y4X4 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLF12Q9Y4X4 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLF12Q9Y4X4 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLF12Q9Y4X4 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLF12Q9Y4X4 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLF12Q9Y4X4 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLF12Q9Y4X4 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLF12Q9Y4X4 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLF12Q9Y4X4 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLF12Q9Y4X4 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
KLF12Q9Y4X4 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLF12Q9Y4X4 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLF12Q9Y4X4 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLF12Q9Y4X4 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
KLF12Q9Y4X4 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLF12Q9Y4X4 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLF12Q9Y4X4 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLF12Q9Y4X4 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLF12Q9Y4X4 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLF12Q9Y4X4 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLF12Q9Y4X4 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLF12Q9Y4X4 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLF12Q9Y4X4 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLF12Q9Y4X4 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLF12Q9Y4X4 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLF12Q9Y4X4 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLF12Q9Y4X4 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLF12Q9Y4X4 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLF12Q9Y4X4 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLF12Q9Y4X4 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLF12Q9Y4X4 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLF12Q9Y4X4 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLF12Q9Y4X4 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLF12Q9Y4X4 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
KLF12Q9Y4X4 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLF12Q9Y4X4 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLF12Q9Y4X4 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLF12Q9Y4X4 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
KLF12Q9Y4X4 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLF12Q9Y4X4 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLF12Q9Y4X4 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
KLF12Q9Y4X4 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLF12Q9Y4X4 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLF12Q9Y4X4 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLF12Q9Y4X4 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLF12Q9Y4X4 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLF12Q9Y4X4 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
KLF12Q9Y4X4 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLF12Q9Y4X4 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLF12Q9Y4X4 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLF12Q9Y4X4 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLF12Q9Y4X4 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLF12Q9Y4X4 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLF12Q9Y4X4 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLF12Q9Y4X4 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLF12Q9Y4X4 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLF12Q9Y4X4 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLF12Q9Y4X4 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLF12Q9Y4X4 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms