Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2S0

POLR1D, DNA-directed RNA polymerases I and III subunit RPAC2, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1DQ9Y2S0 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
POLR1DQ9Y2S0 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
POLR1DQ9Y2S0 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
POLR1DQ9Y2S0 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
POLR1DQ9Y2S0 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
POLR1DQ9Y2S0 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
POLR1DQ9Y2S0 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
POLR1DQ9Y2S0 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
POLR1DQ9Y2S0 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
POLR1DQ9Y2S0 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
POLR1DQ9Y2S0 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
POLR1DQ9Y2S0 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
POLR1DQ9Y2S0 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
POLR1DQ9Y2S0 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
POLR1DQ9Y2S0 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
POLR1DQ9Y2S0 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
POLR1DQ9Y2S0 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
POLR1DQ9Y2S0 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
POLR1DQ9Y2S0 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
POLR1DQ9Y2S0 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
POLR1DQ9Y2S0 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
POLR1DQ9Y2S0 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
POLR1DQ9Y2S0 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
POLR1DQ9Y2S0 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
POLR1DQ9Y2S0 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
POLR1DQ9Y2S0 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
POLR1DQ9Y2S0 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
POLR1DQ9Y2S0 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
POLR1DQ9Y2S0 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
POLR1DQ9Y2S0 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
POLR1DQ9Y2S0 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
POLR1DQ9Y2S0 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
POLR1DQ9Y2S0 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
POLR1DQ9Y2S0 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
POLR1DQ9Y2S0 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
POLR1DQ9Y2S0 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
POLR1DQ9Y2S0 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
POLR1DQ9Y2S0 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
POLR1DQ9Y2S0 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
POLR1DQ9Y2S0 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
POLR1DQ9Y2S0 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
POLR1DQ9Y2S0 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
POLR1DQ9Y2S0 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
POLR1DQ9Y2S0 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
POLR1DQ9Y2S0 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
POLR1DQ9Y2S0 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
POLR1DQ9Y2S0 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
POLR1DQ9Y2S0 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
POLR1DQ9Y2S0 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
POLR1DQ9Y2S0 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
POLR1DQ9Y2S0 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
POLR1DQ9Y2S0 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
POLR1DQ9Y2S0 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
POLR1DQ9Y2S0 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
POLR1DQ9Y2S0 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
POLR1DQ9Y2S0 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
POLR1DQ9Y2S0 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
POLR1DQ9Y2S0 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
POLR1DQ9Y2S0 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
POLR1DQ9Y2S0 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
POLR1DQ9Y2S0 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
POLR1DQ9Y2S0 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
POLR1DQ9Y2S0 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
POLR1DQ9Y2S0 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
POLR1DQ9Y2S0 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
POLR1DQ9Y2S0 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
POLR1DQ9Y2S0 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
POLR1DQ9Y2S0 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
POLR1DQ9Y2S0 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
POLR1DQ9Y2S0 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
POLR1DQ9Y2S0 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
POLR1DQ9Y2S0 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
POLR1DQ9Y2S0 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
POLR1DQ9Y2S0 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
POLR1DQ9Y2S0 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
POLR1DQ9Y2S0 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
POLR1DQ9Y2S0 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
POLR1DQ9Y2S0 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
POLR1DQ9Y2S0 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
POLR1DQ9Y2S0 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
POLR1DQ9Y2S0 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
POLR1DQ9Y2S0 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
POLR1DQ9Y2S0 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
POLR1DQ9Y2S0 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
POLR1DQ9Y2S0 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
POLR1DQ9Y2S0 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
POLR1DQ9Y2S0 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
POLR1DQ9Y2S0 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
POLR1DQ9Y2S0 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
POLR1DQ9Y2S0 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
POLR1DQ9Y2S0 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
POLR1DQ9Y2S0 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
POLR1DQ9Y2S0 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
POLR1DQ9Y2S0 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
POLR1DQ9Y2S0 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
POLR1DQ9Y2S0 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
POLR1DQ9Y2S0 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
POLR1DQ9Y2S0 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
POLR1DQ9Y2S0 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
POLR1DQ9Y2S0 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 207.7 ms