Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQL6

HDAC5, Histone deacetylase 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC5Q9UQL6 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HDAC5Q9UQL6 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
HDAC5Q9UQL6 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HDAC5Q9UQL6 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
HDAC5Q9UQL6 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
HDAC5Q9UQL6 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HDAC5Q9UQL6 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
HDAC5Q9UQL6 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
HDAC5Q9UQL6 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
HDAC5Q9UQL6 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
HDAC5Q9UQL6 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
HDAC5Q9UQL6 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
HDAC5Q9UQL6 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
HDAC5Q9UQL6 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
HDAC5Q9UQL6 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
HDAC5Q9UQL6 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
HDAC5Q9UQL6 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
HDAC5Q9UQL6 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
HDAC5Q9UQL6 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
HDAC5Q9UQL6 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
HDAC5Q9UQL6 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
HDAC5Q9UQL6 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
HDAC5Q9UQL6 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HDAC5Q9UQL6 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
HDAC5Q9UQL6 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
HDAC5Q9UQL6 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HDAC5Q9UQL6 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HDAC5Q9UQL6 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
HDAC5Q9UQL6 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
HDAC5Q9UQL6 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
HDAC5Q9UQL6 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
HDAC5Q9UQL6 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
HDAC5Q9UQL6 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
HDAC5Q9UQL6 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
HDAC5Q9UQL6 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.43■■□□□ 1.66
HDAC5Q9UQL6 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
HDAC5Q9UQL6 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
HDAC5Q9UQL6 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
HDAC5Q9UQL6 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
HDAC5Q9UQL6 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HDAC5Q9UQL6 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HDAC5Q9UQL6 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
HDAC5Q9UQL6 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HDAC5Q9UQL6 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HDAC5Q9UQL6 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
HDAC5Q9UQL6 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HDAC5Q9UQL6 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HDAC5Q9UQL6 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HDAC5Q9UQL6 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
HDAC5Q9UQL6 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
HDAC5Q9UQL6 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
HDAC5Q9UQL6 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HDAC5Q9UQL6 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HDAC5Q9UQL6 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HDAC5Q9UQL6 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HDAC5Q9UQL6 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
HDAC5Q9UQL6 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HDAC5Q9UQL6 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HDAC5Q9UQL6 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HDAC5Q9UQL6 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
HDAC5Q9UQL6 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HDAC5Q9UQL6 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
HDAC5Q9UQL6 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
HDAC5Q9UQL6 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HDAC5Q9UQL6 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
HDAC5Q9UQL6 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
HDAC5Q9UQL6 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
HDAC5Q9UQL6 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
HDAC5Q9UQL6 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
HDAC5Q9UQL6 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
HDAC5Q9UQL6 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
HDAC5Q9UQL6 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
HDAC5Q9UQL6 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
HDAC5Q9UQL6 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
HDAC5Q9UQL6 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
HDAC5Q9UQL6 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
HDAC5Q9UQL6 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
HDAC5Q9UQL6 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
HDAC5Q9UQL6 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
HDAC5Q9UQL6 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
HDAC5Q9UQL6 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
HDAC5Q9UQL6 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
HDAC5Q9UQL6 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
HDAC5Q9UQL6 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
HDAC5Q9UQL6 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
HDAC5Q9UQL6 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
HDAC5Q9UQL6 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HDAC5Q9UQL6 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
HDAC5Q9UQL6 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
HDAC5Q9UQL6 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
HDAC5Q9UQL6 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
HDAC5Q9UQL6 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HDAC5Q9UQL6 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HDAC5Q9UQL6 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
HDAC5Q9UQL6 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HDAC5Q9UQL6 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
HDAC5Q9UQL6 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HDAC5Q9UQL6 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
HDAC5Q9UQL6 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
HDAC5Q9UQL6 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms