Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL40

ZNF346, Zinc finger protein 346, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF346Q9UL40 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF346Q9UL40 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF346Q9UL40 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF346Q9UL40 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF346Q9UL40 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF346Q9UL40 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF346Q9UL40 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF346Q9UL40 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF346Q9UL40 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF346Q9UL40 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF346Q9UL40 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF346Q9UL40 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF346Q9UL40 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF346Q9UL40 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF346Q9UL40 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF346Q9UL40 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF346Q9UL40 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF346Q9UL40 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF346Q9UL40 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF346Q9UL40 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF346Q9UL40 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF346Q9UL40 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF346Q9UL40 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF346Q9UL40 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNF346Q9UL40 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNF346Q9UL40 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNF346Q9UL40 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNF346Q9UL40 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNF346Q9UL40 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNF346Q9UL40 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNF346Q9UL40 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNF346Q9UL40 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNF346Q9UL40 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNF346Q9UL40 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNF346Q9UL40 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNF346Q9UL40 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNF346Q9UL40 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNF346Q9UL40 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNF346Q9UL40 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNF346Q9UL40 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNF346Q9UL40 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNF346Q9UL40 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNF346Q9UL40 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNF346Q9UL40 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNF346Q9UL40 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNF346Q9UL40 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNF346Q9UL40 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNF346Q9UL40 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNF346Q9UL40 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNF346Q9UL40 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNF346Q9UL40 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNF346Q9UL40 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNF346Q9UL40 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNF346Q9UL40 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNF346Q9UL40 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNF346Q9UL40 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNF346Q9UL40 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNF346Q9UL40 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNF346Q9UL40 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNF346Q9UL40 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNF346Q9UL40 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNF346Q9UL40 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNF346Q9UL40 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNF346Q9UL40 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZNF346Q9UL40 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZNF346Q9UL40 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZNF346Q9UL40 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZNF346Q9UL40 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZNF346Q9UL40 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZNF346Q9UL40 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZNF346Q9UL40 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZNF346Q9UL40 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZNF346Q9UL40 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZNF346Q9UL40 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZNF346Q9UL40 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZNF346Q9UL40 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZNF346Q9UL40 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZNF346Q9UL40 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZNF346Q9UL40 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZNF346Q9UL40 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ZNF346Q9UL40 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ZNF346Q9UL40 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ZNF346Q9UL40 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
ZNF346Q9UL40 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF346Q9UL40 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF346Q9UL40 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF346Q9UL40 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF346Q9UL40 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF346Q9UL40 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF346Q9UL40 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF346Q9UL40 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF346Q9UL40 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF346Q9UL40 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF346Q9UL40 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF346Q9UL40 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF346Q9UL40 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF346Q9UL40 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF346Q9UL40 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF346Q9UL40 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF346Q9UL40 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms