Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKX5

ITGA11, Integrin alpha-11, humanhuman

Predictions only

Length 1,188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA11Q9UKX5 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ITGA11Q9UKX5 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ITGA11Q9UKX5 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ITGA11Q9UKX5 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ITGA11Q9UKX5 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ITGA11Q9UKX5 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ITGA11Q9UKX5 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ITGA11Q9UKX5 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ITGA11Q9UKX5 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ITGA11Q9UKX5 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ITGA11Q9UKX5 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ITGA11Q9UKX5 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ITGA11Q9UKX5 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ITGA11Q9UKX5 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ITGA11Q9UKX5 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ITGA11Q9UKX5 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ITGA11Q9UKX5 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ITGA11Q9UKX5 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ITGA11Q9UKX5 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ITGA11Q9UKX5 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
ITGA11Q9UKX5 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ITGA11Q9UKX5 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ITGA11Q9UKX5 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
ITGA11Q9UKX5 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ITGA11Q9UKX5 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ITGA11Q9UKX5 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ITGA11Q9UKX5 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ITGA11Q9UKX5 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ITGA11Q9UKX5 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ITGA11Q9UKX5 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ITGA11Q9UKX5 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ITGA11Q9UKX5 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ITGA11Q9UKX5 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ITGA11Q9UKX5 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ITGA11Q9UKX5 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ITGA11Q9UKX5 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ITGA11Q9UKX5 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ITGA11Q9UKX5 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ITGA11Q9UKX5 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ITGA11Q9UKX5 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ITGA11Q9UKX5 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ITGA11Q9UKX5 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ITGA11Q9UKX5 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ITGA11Q9UKX5 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ITGA11Q9UKX5 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ITGA11Q9UKX5 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ITGA11Q9UKX5 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ITGA11Q9UKX5 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ITGA11Q9UKX5 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ITGA11Q9UKX5 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ITGA11Q9UKX5 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ITGA11Q9UKX5 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ITGA11Q9UKX5 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ITGA11Q9UKX5 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ITGA11Q9UKX5 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ITGA11Q9UKX5 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ITGA11Q9UKX5 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ITGA11Q9UKX5 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ITGA11Q9UKX5 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ITGA11Q9UKX5 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ITGA11Q9UKX5 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ITGA11Q9UKX5 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ITGA11Q9UKX5 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
ITGA11Q9UKX5 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ITGA11Q9UKX5 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ITGA11Q9UKX5 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ITGA11Q9UKX5 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ITGA11Q9UKX5 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ITGA11Q9UKX5 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ITGA11Q9UKX5 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ITGA11Q9UKX5 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ITGA11Q9UKX5 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ITGA11Q9UKX5 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ITGA11Q9UKX5 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ITGA11Q9UKX5 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ITGA11Q9UKX5 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ITGA11Q9UKX5 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ITGA11Q9UKX5 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ITGA11Q9UKX5 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ITGA11Q9UKX5 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ITGA11Q9UKX5 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ITGA11Q9UKX5 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ITGA11Q9UKX5 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ITGA11Q9UKX5 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
ITGA11Q9UKX5 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ITGA11Q9UKX5 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
ITGA11Q9UKX5 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ITGA11Q9UKX5 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ITGA11Q9UKX5 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ITGA11Q9UKX5 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ITGA11Q9UKX5 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ITGA11Q9UKX5 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ITGA11Q9UKX5 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ITGA11Q9UKX5 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ITGA11Q9UKX5 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ITGA11Q9UKX5 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ITGA11Q9UKX5 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ITGA11Q9UKX5 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ITGA11Q9UKX5 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ITGA11Q9UKX5 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.1 ms