Protein–RNA interactions for Protein: Q9UK58

CCNL1, Cyclin-L1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNL1Q9UK58 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCNL1Q9UK58 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCNL1Q9UK58 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCNL1Q9UK58 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCNL1Q9UK58 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCNL1Q9UK58 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCNL1Q9UK58 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
CCNL1Q9UK58 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCNL1Q9UK58 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCNL1Q9UK58 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCNL1Q9UK58 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCNL1Q9UK58 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CCNL1Q9UK58 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
CCNL1Q9UK58 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCNL1Q9UK58 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCNL1Q9UK58 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCNL1Q9UK58 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
CCNL1Q9UK58 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
CCNL1Q9UK58 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCNL1Q9UK58 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCNL1Q9UK58 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
CCNL1Q9UK58 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCNL1Q9UK58 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCNL1Q9UK58 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCNL1Q9UK58 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCNL1Q9UK58 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCNL1Q9UK58 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCNL1Q9UK58 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
CCNL1Q9UK58 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCNL1Q9UK58 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCNL1Q9UK58 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCNL1Q9UK58 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCNL1Q9UK58 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCNL1Q9UK58 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCNL1Q9UK58 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCNL1Q9UK58 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCNL1Q9UK58 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCNL1Q9UK58 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCNL1Q9UK58 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCNL1Q9UK58 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCNL1Q9UK58 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCNL1Q9UK58 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCNL1Q9UK58 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCNL1Q9UK58 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
CCNL1Q9UK58 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCNL1Q9UK58 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCNL1Q9UK58 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCNL1Q9UK58 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCNL1Q9UK58 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCNL1Q9UK58 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCNL1Q9UK58 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCNL1Q9UK58 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCNL1Q9UK58 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCNL1Q9UK58 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCNL1Q9UK58 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCNL1Q9UK58 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCNL1Q9UK58 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCNL1Q9UK58 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCNL1Q9UK58 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCNL1Q9UK58 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCNL1Q9UK58 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCNL1Q9UK58 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
CCNL1Q9UK58 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCNL1Q9UK58 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCNL1Q9UK58 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCNL1Q9UK58 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCNL1Q9UK58 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCNL1Q9UK58 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCNL1Q9UK58 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCNL1Q9UK58 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCNL1Q9UK58 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCNL1Q9UK58 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCNL1Q9UK58 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCNL1Q9UK58 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCNL1Q9UK58 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCNL1Q9UK58 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCNL1Q9UK58 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCNL1Q9UK58 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCNL1Q9UK58 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCNL1Q9UK58 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCNL1Q9UK58 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCNL1Q9UK58 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.76
CCNL1Q9UK58 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCNL1Q9UK58 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCNL1Q9UK58 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCNL1Q9UK58 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCNL1Q9UK58 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCNL1Q9UK58 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
CCNL1Q9UK58 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
CCNL1Q9UK58 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCNL1Q9UK58 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCNL1Q9UK58 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
CCNL1Q9UK58 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCNL1Q9UK58 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCNL1Q9UK58 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCNL1Q9UK58 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCNL1Q9UK58 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCNL1Q9UK58 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCNL1Q9UK58 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCNL1Q9UK58 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms