Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJW0

DCTN4, Dynactin subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 460 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCTN4Q9UJW0 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DCTN4Q9UJW0 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DCTN4Q9UJW0 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DCTN4Q9UJW0 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DCTN4Q9UJW0 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DCTN4Q9UJW0 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DCTN4Q9UJW0 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DCTN4Q9UJW0 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DCTN4Q9UJW0 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DCTN4Q9UJW0 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
DCTN4Q9UJW0 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DCTN4Q9UJW0 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
DCTN4Q9UJW0 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DCTN4Q9UJW0 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DCTN4Q9UJW0 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DCTN4Q9UJW0 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DCTN4Q9UJW0 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DCTN4Q9UJW0 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DCTN4Q9UJW0 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DCTN4Q9UJW0 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DCTN4Q9UJW0 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DCTN4Q9UJW0 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DCTN4Q9UJW0 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DCTN4Q9UJW0 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DCTN4Q9UJW0 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DCTN4Q9UJW0 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
DCTN4Q9UJW0 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DCTN4Q9UJW0 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DCTN4Q9UJW0 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DCTN4Q9UJW0 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DCTN4Q9UJW0 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DCTN4Q9UJW0 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
DCTN4Q9UJW0 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
DCTN4Q9UJW0 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
DCTN4Q9UJW0 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
DCTN4Q9UJW0 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
DCTN4Q9UJW0 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
DCTN4Q9UJW0 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
DCTN4Q9UJW0 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
DCTN4Q9UJW0 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
DCTN4Q9UJW0 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
DCTN4Q9UJW0 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
DCTN4Q9UJW0 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
DCTN4Q9UJW0 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
DCTN4Q9UJW0 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
DCTN4Q9UJW0 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
DCTN4Q9UJW0 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
DCTN4Q9UJW0 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
DCTN4Q9UJW0 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
DCTN4Q9UJW0 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
DCTN4Q9UJW0 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
DCTN4Q9UJW0 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
DCTN4Q9UJW0 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
DCTN4Q9UJW0 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
DCTN4Q9UJW0 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DCTN4Q9UJW0 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
DCTN4Q9UJW0 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DCTN4Q9UJW0 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DCTN4Q9UJW0 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DCTN4Q9UJW0 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
DCTN4Q9UJW0 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DCTN4Q9UJW0 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DCTN4Q9UJW0 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DCTN4Q9UJW0 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
DCTN4Q9UJW0 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DCTN4Q9UJW0 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DCTN4Q9UJW0 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
DCTN4Q9UJW0 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
DCTN4Q9UJW0 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
DCTN4Q9UJW0 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
DCTN4Q9UJW0 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
DCTN4Q9UJW0 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DCTN4Q9UJW0 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DCTN4Q9UJW0 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DCTN4Q9UJW0 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DCTN4Q9UJW0 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DCTN4Q9UJW0 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DCTN4Q9UJW0 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DCTN4Q9UJW0 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
DCTN4Q9UJW0 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DCTN4Q9UJW0 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
DCTN4Q9UJW0 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DCTN4Q9UJW0 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
DCTN4Q9UJW0 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DCTN4Q9UJW0 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DCTN4Q9UJW0 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DCTN4Q9UJW0 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
DCTN4Q9UJW0 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
DCTN4Q9UJW0 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
DCTN4Q9UJW0 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DCTN4Q9UJW0 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DCTN4Q9UJW0 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
DCTN4Q9UJW0 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DCTN4Q9UJW0 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DCTN4Q9UJW0 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DCTN4Q9UJW0 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DCTN4Q9UJW0 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
DCTN4Q9UJW0 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
DCTN4Q9UJW0 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
DCTN4Q9UJW0 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms