Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC9

NPC1L1, Niemann-Pick C1-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPC1L1Q9UHC9 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
NPC1L1Q9UHC9 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC27.53■■■□□ 2
NPC1L1Q9UHC9 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC27.53■■■□□ 2
NPC1L1Q9UHC9 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NPC1L1Q9UHC9 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NPC1L1Q9UHC9 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NPC1L1Q9UHC9 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NPC1L1Q9UHC9 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
NPC1L1Q9UHC9 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NPC1L1Q9UHC9 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
NPC1L1Q9UHC9 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NPC1L1Q9UHC9 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
NPC1L1Q9UHC9 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
NPC1L1Q9UHC9 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
NPC1L1Q9UHC9 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NPC1L1Q9UHC9 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NPC1L1Q9UHC9 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NPC1L1Q9UHC9 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NPC1L1Q9UHC9 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NPC1L1Q9UHC9 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
NPC1L1Q9UHC9 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NPC1L1Q9UHC9 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NPC1L1Q9UHC9 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NPC1L1Q9UHC9 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
NPC1L1Q9UHC9 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NPC1L1Q9UHC9 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NPC1L1Q9UHC9 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
NPC1L1Q9UHC9 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
NPC1L1Q9UHC9 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
NPC1L1Q9UHC9 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
NPC1L1Q9UHC9 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
NPC1L1Q9UHC9 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NPC1L1Q9UHC9 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NPC1L1Q9UHC9 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NPC1L1Q9UHC9 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
NPC1L1Q9UHC9 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NPC1L1Q9UHC9 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NPC1L1Q9UHC9 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
NPC1L1Q9UHC9 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
NPC1L1Q9UHC9 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
NPC1L1Q9UHC9 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
NPC1L1Q9UHC9 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NPC1L1Q9UHC9 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NPC1L1Q9UHC9 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NPC1L1Q9UHC9 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NPC1L1Q9UHC9 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
NPC1L1Q9UHC9 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NPC1L1Q9UHC9 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NPC1L1Q9UHC9 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NPC1L1Q9UHC9 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NPC1L1Q9UHC9 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
NPC1L1Q9UHC9 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NPC1L1Q9UHC9 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
NPC1L1Q9UHC9 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
NPC1L1Q9UHC9 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.49■■□□□ 1.99
NPC1L1Q9UHC9 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NPC1L1Q9UHC9 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
NPC1L1Q9UHC9 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
NPC1L1Q9UHC9 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NPC1L1Q9UHC9 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
NPC1L1Q9UHC9 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
NPC1L1Q9UHC9 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
NPC1L1Q9UHC9 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NPC1L1Q9UHC9 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
NPC1L1Q9UHC9 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NPC1L1Q9UHC9 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NPC1L1Q9UHC9 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
NPC1L1Q9UHC9 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
NPC1L1Q9UHC9 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NPC1L1Q9UHC9 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NPC1L1Q9UHC9 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NPC1L1Q9UHC9 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
NPC1L1Q9UHC9 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
NPC1L1Q9UHC9 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NPC1L1Q9UHC9 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
NPC1L1Q9UHC9 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
NPC1L1Q9UHC9 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
NPC1L1Q9UHC9 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
NPC1L1Q9UHC9 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
NPC1L1Q9UHC9 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
NPC1L1Q9UHC9 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
NPC1L1Q9UHC9 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
NPC1L1Q9UHC9 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
NPC1L1Q9UHC9 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
NPC1L1Q9UHC9 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
NPC1L1Q9UHC9 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
NPC1L1Q9UHC9 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
NPC1L1Q9UHC9 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
NPC1L1Q9UHC9 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
NPC1L1Q9UHC9 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
NPC1L1Q9UHC9 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
NPC1L1Q9UHC9 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
NPC1L1Q9UHC9 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
NPC1L1Q9UHC9 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
NPC1L1Q9UHC9 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
NPC1L1Q9UHC9 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
NPC1L1Q9UHC9 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
NPC1L1Q9UHC9 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
NPC1L1Q9UHC9 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
NPC1L1Q9UHC9 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms