Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC6

CNTNAP2, Contactin-associated protein-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTNAP2Q9UHC6 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CNTNAP2Q9UHC6 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CNTNAP2Q9UHC6 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CNTNAP2Q9UHC6 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CNTNAP2Q9UHC6 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CNTNAP2Q9UHC6 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CNTNAP2Q9UHC6 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CNTNAP2Q9UHC6 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CNTNAP2Q9UHC6 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNTNAP2Q9UHC6 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNTNAP2Q9UHC6 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNTNAP2Q9UHC6 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNTNAP2Q9UHC6 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNTNAP2Q9UHC6 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNTNAP2Q9UHC6 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNTNAP2Q9UHC6 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNTNAP2Q9UHC6 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNTNAP2Q9UHC6 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNTNAP2Q9UHC6 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNTNAP2Q9UHC6 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNTNAP2Q9UHC6 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNTNAP2Q9UHC6 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNTNAP2Q9UHC6 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNTNAP2Q9UHC6 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNTNAP2Q9UHC6 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNTNAP2Q9UHC6 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CNTNAP2Q9UHC6 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CNTNAP2Q9UHC6 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CNTNAP2Q9UHC6 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CNTNAP2Q9UHC6 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CNTNAP2Q9UHC6 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CNTNAP2Q9UHC6 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CNTNAP2Q9UHC6 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CNTNAP2Q9UHC6 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CNTNAP2Q9UHC6 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CNTNAP2Q9UHC6 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CNTNAP2Q9UHC6 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CNTNAP2Q9UHC6 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CNTNAP2Q9UHC6 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CNTNAP2Q9UHC6 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CNTNAP2Q9UHC6 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CNTNAP2Q9UHC6 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CNTNAP2Q9UHC6 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CNTNAP2Q9UHC6 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CNTNAP2Q9UHC6 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CNTNAP2Q9UHC6 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CNTNAP2Q9UHC6 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CNTNAP2Q9UHC6 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CNTNAP2Q9UHC6 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CNTNAP2Q9UHC6 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CNTNAP2Q9UHC6 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
CNTNAP2Q9UHC6 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
CNTNAP2Q9UHC6 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
CNTNAP2Q9UHC6 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
CNTNAP2Q9UHC6 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CNTNAP2Q9UHC6 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CNTNAP2Q9UHC6 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CNTNAP2Q9UHC6 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CNTNAP2Q9UHC6 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CNTNAP2Q9UHC6 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CNTNAP2Q9UHC6 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CNTNAP2Q9UHC6 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CNTNAP2Q9UHC6 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CNTNAP2Q9UHC6 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CNTNAP2Q9UHC6 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CNTNAP2Q9UHC6 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CNTNAP2Q9UHC6 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CNTNAP2Q9UHC6 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CNTNAP2Q9UHC6 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CNTNAP2Q9UHC6 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CNTNAP2Q9UHC6 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CNTNAP2Q9UHC6 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CNTNAP2Q9UHC6 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CNTNAP2Q9UHC6 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CNTNAP2Q9UHC6 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CNTNAP2Q9UHC6 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CNTNAP2Q9UHC6 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CNTNAP2Q9UHC6 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CNTNAP2Q9UHC6 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CNTNAP2Q9UHC6 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CNTNAP2Q9UHC6 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CNTNAP2Q9UHC6 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CNTNAP2Q9UHC6 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CNTNAP2Q9UHC6 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CNTNAP2Q9UHC6 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CNTNAP2Q9UHC6 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CNTNAP2Q9UHC6 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CNTNAP2Q9UHC6 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CNTNAP2Q9UHC6 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CNTNAP2Q9UHC6 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CNTNAP2Q9UHC6 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CNTNAP2Q9UHC6 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CNTNAP2Q9UHC6 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CNTNAP2Q9UHC6 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CNTNAP2Q9UHC6 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CNTNAP2Q9UHC6 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CNTNAP2Q9UHC6 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CNTNAP2Q9UHC6 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CNTNAP2Q9UHC6 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CNTNAP2Q9UHC6 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms