Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHA2

SS18L2, SS18-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SS18L2Q9UHA2 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SS18L2Q9UHA2 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
SS18L2Q9UHA2 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SS18L2Q9UHA2 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SS18L2Q9UHA2 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SS18L2Q9UHA2 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SS18L2Q9UHA2 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
SS18L2Q9UHA2 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SS18L2Q9UHA2 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SS18L2Q9UHA2 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SS18L2Q9UHA2 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SS18L2Q9UHA2 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SS18L2Q9UHA2 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SS18L2Q9UHA2 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SS18L2Q9UHA2 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SS18L2Q9UHA2 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
SS18L2Q9UHA2 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
SS18L2Q9UHA2 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SS18L2Q9UHA2 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SS18L2Q9UHA2 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SS18L2Q9UHA2 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SS18L2Q9UHA2 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SS18L2Q9UHA2 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SS18L2Q9UHA2 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SS18L2Q9UHA2 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
SS18L2Q9UHA2 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
SS18L2Q9UHA2 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SS18L2Q9UHA2 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SS18L2Q9UHA2 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SS18L2Q9UHA2 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SS18L2Q9UHA2 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SS18L2Q9UHA2 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SS18L2Q9UHA2 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SS18L2Q9UHA2 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SS18L2Q9UHA2 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SS18L2Q9UHA2 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SS18L2Q9UHA2 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SS18L2Q9UHA2 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SS18L2Q9UHA2 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SS18L2Q9UHA2 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SS18L2Q9UHA2 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SS18L2Q9UHA2 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SS18L2Q9UHA2 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SS18L2Q9UHA2 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SS18L2Q9UHA2 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SS18L2Q9UHA2 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.31
SS18L2Q9UHA2 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
SS18L2Q9UHA2 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.31
SS18L2Q9UHA2 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SS18L2Q9UHA2 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
SS18L2Q9UHA2 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SS18L2Q9UHA2 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SS18L2Q9UHA2 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SS18L2Q9UHA2 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SS18L2Q9UHA2 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SS18L2Q9UHA2 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SS18L2Q9UHA2 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SS18L2Q9UHA2 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SS18L2Q9UHA2 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SS18L2Q9UHA2 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SS18L2Q9UHA2 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SS18L2Q9UHA2 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SS18L2Q9UHA2 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SS18L2Q9UHA2 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SS18L2Q9UHA2 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SS18L2Q9UHA2 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SS18L2Q9UHA2 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SS18L2Q9UHA2 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SS18L2Q9UHA2 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SS18L2Q9UHA2 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SS18L2Q9UHA2 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SS18L2Q9UHA2 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SS18L2Q9UHA2 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SS18L2Q9UHA2 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SS18L2Q9UHA2 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SS18L2Q9UHA2 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SS18L2Q9UHA2 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SS18L2Q9UHA2 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SS18L2Q9UHA2 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SS18L2Q9UHA2 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SS18L2Q9UHA2 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SS18L2Q9UHA2 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SS18L2Q9UHA2 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SS18L2Q9UHA2 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SS18L2Q9UHA2 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SS18L2Q9UHA2 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SS18L2Q9UHA2 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SS18L2Q9UHA2 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SS18L2Q9UHA2 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SS18L2Q9UHA2 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SS18L2Q9UHA2 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SS18L2Q9UHA2 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SS18L2Q9UHA2 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SS18L2Q9UHA2 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SS18L2Q9UHA2 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SS18L2Q9UHA2 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SS18L2Q9UHA2 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SS18L2Q9UHA2 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SS18L2Q9UHA2 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
SS18L2Q9UHA2 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms