Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBE8

NLK, Serine/threonine-protein kinase NLK, humanhuman

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLKQ9UBE8 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
NLKQ9UBE8 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NLKQ9UBE8 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NLKQ9UBE8 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NLKQ9UBE8 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NLKQ9UBE8 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NLKQ9UBE8 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NLKQ9UBE8 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NLKQ9UBE8 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NLKQ9UBE8 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NLKQ9UBE8 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NLKQ9UBE8 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NLKQ9UBE8 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
NLKQ9UBE8 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NLKQ9UBE8 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NLKQ9UBE8 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NLKQ9UBE8 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NLKQ9UBE8 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NLKQ9UBE8 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NLKQ9UBE8 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NLKQ9UBE8 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NLKQ9UBE8 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NLKQ9UBE8 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
NLKQ9UBE8 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NLKQ9UBE8 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NLKQ9UBE8 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NLKQ9UBE8 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NLKQ9UBE8 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NLKQ9UBE8 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NLKQ9UBE8 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NLKQ9UBE8 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NLKQ9UBE8 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NLKQ9UBE8 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NLKQ9UBE8 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NLKQ9UBE8 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NLKQ9UBE8 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NLKQ9UBE8 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NLKQ9UBE8 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NLKQ9UBE8 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
NLKQ9UBE8 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NLKQ9UBE8 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NLKQ9UBE8 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NLKQ9UBE8 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NLKQ9UBE8 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NLKQ9UBE8 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NLKQ9UBE8 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NLKQ9UBE8 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NLKQ9UBE8 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NLKQ9UBE8 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NLKQ9UBE8 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NLKQ9UBE8 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NLKQ9UBE8 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NLKQ9UBE8 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
NLKQ9UBE8 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NLKQ9UBE8 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NLKQ9UBE8 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NLKQ9UBE8 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NLKQ9UBE8 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NLKQ9UBE8 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NLKQ9UBE8 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NLKQ9UBE8 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NLKQ9UBE8 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NLKQ9UBE8 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NLKQ9UBE8 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NLKQ9UBE8 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NLKQ9UBE8 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NLKQ9UBE8 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NLKQ9UBE8 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NLKQ9UBE8 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NLKQ9UBE8 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NLKQ9UBE8 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NLKQ9UBE8 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NLKQ9UBE8 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NLKQ9UBE8 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NLKQ9UBE8 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NLKQ9UBE8 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NLKQ9UBE8 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NLKQ9UBE8 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NLKQ9UBE8 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NLKQ9UBE8 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NLKQ9UBE8 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NLKQ9UBE8 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NLKQ9UBE8 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NLKQ9UBE8 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NLKQ9UBE8 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NLKQ9UBE8 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NLKQ9UBE8 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NLKQ9UBE8 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NLKQ9UBE8 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NLKQ9UBE8 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NLKQ9UBE8 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NLKQ9UBE8 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NLKQ9UBE8 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NLKQ9UBE8 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NLKQ9UBE8 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NLKQ9UBE8 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
NLKQ9UBE8 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NLKQ9UBE8 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NLKQ9UBE8 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NLKQ9UBE8 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms