Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0W5

SCHIP1, Schwannomin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCHIP1Q9P0W5 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SCHIP1Q9P0W5 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SCHIP1Q9P0W5 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SCHIP1Q9P0W5 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SCHIP1Q9P0W5 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SCHIP1Q9P0W5 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SCHIP1Q9P0W5 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SCHIP1Q9P0W5 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SCHIP1Q9P0W5 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SCHIP1Q9P0W5 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SCHIP1Q9P0W5 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SCHIP1Q9P0W5 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SCHIP1Q9P0W5 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SCHIP1Q9P0W5 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SCHIP1Q9P0W5 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SCHIP1Q9P0W5 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SCHIP1Q9P0W5 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SCHIP1Q9P0W5 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SCHIP1Q9P0W5 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SCHIP1Q9P0W5 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SCHIP1Q9P0W5 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SCHIP1Q9P0W5 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
SCHIP1Q9P0W5 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SCHIP1Q9P0W5 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
SCHIP1Q9P0W5 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
SCHIP1Q9P0W5 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SCHIP1Q9P0W5 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SCHIP1Q9P0W5 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SCHIP1Q9P0W5 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
SCHIP1Q9P0W5 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SCHIP1Q9P0W5 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SCHIP1Q9P0W5 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
SCHIP1Q9P0W5 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SCHIP1Q9P0W5 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
SCHIP1Q9P0W5 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SCHIP1Q9P0W5 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SCHIP1Q9P0W5 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SCHIP1Q9P0W5 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SCHIP1Q9P0W5 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
SCHIP1Q9P0W5 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
SCHIP1Q9P0W5 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SCHIP1Q9P0W5 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SCHIP1Q9P0W5 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SCHIP1Q9P0W5 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SCHIP1Q9P0W5 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SCHIP1Q9P0W5 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SCHIP1Q9P0W5 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SCHIP1Q9P0W5 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SCHIP1Q9P0W5 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SCHIP1Q9P0W5 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SCHIP1Q9P0W5 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SCHIP1Q9P0W5 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SCHIP1Q9P0W5 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SCHIP1Q9P0W5 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SCHIP1Q9P0W5 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SCHIP1Q9P0W5 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SCHIP1Q9P0W5 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SCHIP1Q9P0W5 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SCHIP1Q9P0W5 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SCHIP1Q9P0W5 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SCHIP1Q9P0W5 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SCHIP1Q9P0W5 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SCHIP1Q9P0W5 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SCHIP1Q9P0W5 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SCHIP1Q9P0W5 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SCHIP1Q9P0W5 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SCHIP1Q9P0W5 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SCHIP1Q9P0W5 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SCHIP1Q9P0W5 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SCHIP1Q9P0W5 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SCHIP1Q9P0W5 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SCHIP1Q9P0W5 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SCHIP1Q9P0W5 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SCHIP1Q9P0W5 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SCHIP1Q9P0W5 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SCHIP1Q9P0W5 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SCHIP1Q9P0W5 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SCHIP1Q9P0W5 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SCHIP1Q9P0W5 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SCHIP1Q9P0W5 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SCHIP1Q9P0W5 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SCHIP1Q9P0W5 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SCHIP1Q9P0W5 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SCHIP1Q9P0W5 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SCHIP1Q9P0W5 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SCHIP1Q9P0W5 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SCHIP1Q9P0W5 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SCHIP1Q9P0W5 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SCHIP1Q9P0W5 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SCHIP1Q9P0W5 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SCHIP1Q9P0W5 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SCHIP1Q9P0W5 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SCHIP1Q9P0W5 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SCHIP1Q9P0W5 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SCHIP1Q9P0W5 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SCHIP1Q9P0W5 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SCHIP1Q9P0W5 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SCHIP1Q9P0W5 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SCHIP1Q9P0W5 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SCHIP1Q9P0W5 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms