Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0W0

IFNK, Interferon kappa, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNKQ9P0W0 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
IFNKQ9P0W0 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
IFNKQ9P0W0 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
IFNKQ9P0W0 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
IFNKQ9P0W0 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
IFNKQ9P0W0 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
IFNKQ9P0W0 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
IFNKQ9P0W0 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
IFNKQ9P0W0 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
IFNKQ9P0W0 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
IFNKQ9P0W0 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
IFNKQ9P0W0 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
IFNKQ9P0W0 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
IFNKQ9P0W0 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
IFNKQ9P0W0 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
IFNKQ9P0W0 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
IFNKQ9P0W0 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
IFNKQ9P0W0 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
IFNKQ9P0W0 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
IFNKQ9P0W0 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
IFNKQ9P0W0 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
IFNKQ9P0W0 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
IFNKQ9P0W0 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
IFNKQ9P0W0 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
IFNKQ9P0W0 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
IFNKQ9P0W0 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
IFNKQ9P0W0 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
IFNKQ9P0W0 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
IFNKQ9P0W0 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
IFNKQ9P0W0 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
IFNKQ9P0W0 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
IFNKQ9P0W0 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
IFNKQ9P0W0 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
IFNKQ9P0W0 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
IFNKQ9P0W0 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
IFNKQ9P0W0 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
IFNKQ9P0W0 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
IFNKQ9P0W0 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
IFNKQ9P0W0 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
IFNKQ9P0W0 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
IFNKQ9P0W0 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
IFNKQ9P0W0 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
IFNKQ9P0W0 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
IFNKQ9P0W0 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
IFNKQ9P0W0 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
IFNKQ9P0W0 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
IFNKQ9P0W0 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
IFNKQ9P0W0 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
IFNKQ9P0W0 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
IFNKQ9P0W0 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
IFNKQ9P0W0 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
IFNKQ9P0W0 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
IFNKQ9P0W0 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
IFNKQ9P0W0 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
IFNKQ9P0W0 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
IFNKQ9P0W0 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
IFNKQ9P0W0 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
IFNKQ9P0W0 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
IFNKQ9P0W0 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
IFNKQ9P0W0 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
IFNKQ9P0W0 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
IFNKQ9P0W0 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
IFNKQ9P0W0 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
IFNKQ9P0W0 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
IFNKQ9P0W0 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
IFNKQ9P0W0 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
IFNKQ9P0W0 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
IFNKQ9P0W0 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
IFNKQ9P0W0 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
IFNKQ9P0W0 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
IFNKQ9P0W0 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
IFNKQ9P0W0 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
IFNKQ9P0W0 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
IFNKQ9P0W0 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
IFNKQ9P0W0 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
IFNKQ9P0W0 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
IFNKQ9P0W0 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
IFNKQ9P0W0 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
IFNKQ9P0W0 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
IFNKQ9P0W0 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
IFNKQ9P0W0 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
IFNKQ9P0W0 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
IFNKQ9P0W0 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
IFNKQ9P0W0 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
IFNKQ9P0W0 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
IFNKQ9P0W0 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
IFNKQ9P0W0 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
IFNKQ9P0W0 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
IFNKQ9P0W0 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
IFNKQ9P0W0 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
IFNKQ9P0W0 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
IFNKQ9P0W0 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
IFNKQ9P0W0 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
IFNKQ9P0W0 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
IFNKQ9P0W0 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
IFNKQ9P0W0 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
IFNKQ9P0W0 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
IFNKQ9P0W0 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
IFNKQ9P0W0 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
IFNKQ9P0W0 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.1 ms