Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSP4

CENPM, Centromere protein M, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPMQ9NSP4 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CENPMQ9NSP4 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CENPMQ9NSP4 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CENPMQ9NSP4 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CENPMQ9NSP4 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CENPMQ9NSP4 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CENPMQ9NSP4 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CENPMQ9NSP4 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CENPMQ9NSP4 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CENPMQ9NSP4 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CENPMQ9NSP4 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CENPMQ9NSP4 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CENPMQ9NSP4 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CENPMQ9NSP4 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CENPMQ9NSP4 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CENPMQ9NSP4 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CENPMQ9NSP4 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CENPMQ9NSP4 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CENPMQ9NSP4 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CENPMQ9NSP4 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CENPMQ9NSP4 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CENPMQ9NSP4 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CENPMQ9NSP4 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CENPMQ9NSP4 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CENPMQ9NSP4 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CENPMQ9NSP4 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CENPMQ9NSP4 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CENPMQ9NSP4 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CENPMQ9NSP4 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CENPMQ9NSP4 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CENPMQ9NSP4 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CENPMQ9NSP4 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CENPMQ9NSP4 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CENPMQ9NSP4 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CENPMQ9NSP4 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CENPMQ9NSP4 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CENPMQ9NSP4 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CENPMQ9NSP4 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CENPMQ9NSP4 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CENPMQ9NSP4 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CENPMQ9NSP4 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CENPMQ9NSP4 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CENPMQ9NSP4 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CENPMQ9NSP4 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CENPMQ9NSP4 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CENPMQ9NSP4 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
CENPMQ9NSP4 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CENPMQ9NSP4 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CENPMQ9NSP4 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CENPMQ9NSP4 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CENPMQ9NSP4 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CENPMQ9NSP4 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CENPMQ9NSP4 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CENPMQ9NSP4 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CENPMQ9NSP4 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CENPMQ9NSP4 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CENPMQ9NSP4 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CENPMQ9NSP4 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CENPMQ9NSP4 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CENPMQ9NSP4 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CENPMQ9NSP4 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CENPMQ9NSP4 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CENPMQ9NSP4 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CENPMQ9NSP4 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CENPMQ9NSP4 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CENPMQ9NSP4 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CENPMQ9NSP4 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CENPMQ9NSP4 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CENPMQ9NSP4 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CENPMQ9NSP4 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CENPMQ9NSP4 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CENPMQ9NSP4 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CENPMQ9NSP4 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CENPMQ9NSP4 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CENPMQ9NSP4 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CENPMQ9NSP4 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CENPMQ9NSP4 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CENPMQ9NSP4 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CENPMQ9NSP4 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CENPMQ9NSP4 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CENPMQ9NSP4 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CENPMQ9NSP4 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CENPMQ9NSP4 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CENPMQ9NSP4 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CENPMQ9NSP4 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CENPMQ9NSP4 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CENPMQ9NSP4 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CENPMQ9NSP4 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CENPMQ9NSP4 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CENPMQ9NSP4 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CENPMQ9NSP4 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CENPMQ9NSP4 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CENPMQ9NSP4 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CENPMQ9NSP4 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CENPMQ9NSP4 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CENPMQ9NSP4 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CENPMQ9NSP4 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CENPMQ9NSP4 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CENPMQ9NSP4 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CENPMQ9NSP4 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms