Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRX2

MRPL17, 39S ribosomal protein L17, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 175 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL17Q9NRX2 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MRPL17Q9NRX2 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MRPL17Q9NRX2 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MRPL17Q9NRX2 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MRPL17Q9NRX2 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MRPL17Q9NRX2 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MRPL17Q9NRX2 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
MRPL17Q9NRX2 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MRPL17Q9NRX2 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MRPL17Q9NRX2 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MRPL17Q9NRX2 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MRPL17Q9NRX2 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MRPL17Q9NRX2 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MRPL17Q9NRX2 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MRPL17Q9NRX2 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MRPL17Q9NRX2 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MRPL17Q9NRX2 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MRPL17Q9NRX2 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MRPL17Q9NRX2 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MRPL17Q9NRX2 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MRPL17Q9NRX2 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MRPL17Q9NRX2 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
MRPL17Q9NRX2 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MRPL17Q9NRX2 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MRPL17Q9NRX2 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
MRPL17Q9NRX2 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MRPL17Q9NRX2 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MRPL17Q9NRX2 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
MRPL17Q9NRX2 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
MRPL17Q9NRX2 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
MRPL17Q9NRX2 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
MRPL17Q9NRX2 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
MRPL17Q9NRX2 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MRPL17Q9NRX2 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MRPL17Q9NRX2 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
MRPL17Q9NRX2 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
MRPL17Q9NRX2 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
MRPL17Q9NRX2 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
MRPL17Q9NRX2 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
MRPL17Q9NRX2 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
MRPL17Q9NRX2 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
MRPL17Q9NRX2 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
MRPL17Q9NRX2 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MRPL17Q9NRX2 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MRPL17Q9NRX2 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MRPL17Q9NRX2 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MRPL17Q9NRX2 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MRPL17Q9NRX2 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MRPL17Q9NRX2 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MRPL17Q9NRX2 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MRPL17Q9NRX2 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MRPL17Q9NRX2 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MRPL17Q9NRX2 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
MRPL17Q9NRX2 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MRPL17Q9NRX2 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
MRPL17Q9NRX2 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MRPL17Q9NRX2 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MRPL17Q9NRX2 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MRPL17Q9NRX2 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MRPL17Q9NRX2 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MRPL17Q9NRX2 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MRPL17Q9NRX2 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MRPL17Q9NRX2 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MRPL17Q9NRX2 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MRPL17Q9NRX2 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MRPL17Q9NRX2 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MRPL17Q9NRX2 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MRPL17Q9NRX2 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MRPL17Q9NRX2 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MRPL17Q9NRX2 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MRPL17Q9NRX2 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MRPL17Q9NRX2 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
MRPL17Q9NRX2 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MRPL17Q9NRX2 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MRPL17Q9NRX2 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MRPL17Q9NRX2 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MRPL17Q9NRX2 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MRPL17Q9NRX2 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MRPL17Q9NRX2 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MRPL17Q9NRX2 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MRPL17Q9NRX2 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MRPL17Q9NRX2 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MRPL17Q9NRX2 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MRPL17Q9NRX2 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MRPL17Q9NRX2 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MRPL17Q9NRX2 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MRPL17Q9NRX2 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MRPL17Q9NRX2 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MRPL17Q9NRX2 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MRPL17Q9NRX2 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MRPL17Q9NRX2 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MRPL17Q9NRX2 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MRPL17Q9NRX2 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MRPL17Q9NRX2 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MRPL17Q9NRX2 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MRPL17Q9NRX2 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MRPL17Q9NRX2 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MRPL17Q9NRX2 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MRPL17Q9NRX2 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MRPL17Q9NRX2 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms